100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1855 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  68.42 
 
 
511 aa  644    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
441 aa  895    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  44.52 
 
 
514 aa  345  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2482  extracellular solute-binding protein family 1  50.35 
 
 
400 aa  276  6e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0758562  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 
439 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
414 aa  111  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
411 aa  108  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 
411 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 
425 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  25.69 
 
 
446 aa  108  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 
413 aa  107  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 
423 aa  106  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 
436 aa  106  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 
439 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 
466 aa  102  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
423 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 
422 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24 
 
 
428 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 
430 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
440 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
411 aa  100  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 
419 aa  96.7  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 
437 aa  96.3  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.05 
 
 
421 aa  94  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2483  sugar ABC transporter substrate binding protein  46.53 
 
 
103 aa  93.6  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
455 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 
421 aa  90.9  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
420 aa  89.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
424 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 
522 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.78 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 
421 aa  79.7  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.85 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  24.43 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 
434 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  21.47 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  23.48 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  27.53 
 
 
438 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
426 aa  66.2  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 
363 aa  64.3  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 
448 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 
473 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 
410 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 
453 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 
410 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  21.69 
 
 
412 aa  57.4  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  22.93 
 
 
418 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 
415 aa  56.6  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 
436 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  20.75 
 
 
431 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 
400 aa  54.3  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.81 
 
 
454 aa  54.3  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 
423 aa  53.1  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.5 
 
 
428 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 
459 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 
447 aa  50.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  21.56 
 
 
437 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1658  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 
449 aa  48.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.521221  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3005  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 
386 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0509574  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  22.69 
 
 
433 aa  47  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 
435 aa  45.8  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23 
 
 
434 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 
430 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
452 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  21.25 
 
 
426 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.77 
 
 
399 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
447 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.52 
 
 
521 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4190  extracellular solute-binding protein  28.46 
 
 
431 aa  44.3  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 
437 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5926  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.72 
 
 
441 aa  43.9  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.517551  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3854  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 
439 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0872  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.73 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0079  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.73 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0631  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.73 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1034  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2465  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.73 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0333  maltose/mannitol ABC transporter, periplasmic maltose/mannitol-binding protein, putative  26.73 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00410857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0876  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, periplasmic sorbitol/mannitol-binding protein  26.73 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0755942  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2075  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
433 aa  43.5  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.235936 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2511  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 
441 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0464819  normal  0.359234 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 
436 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1269  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 
412 aa  43.5  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2643  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 
441 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0222782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 
454 aa  43.5  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 
415 aa  43.5  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
449 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 
440 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 
437 aa  43.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  22.63 
 
 
432 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>