More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3687 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 453 aa  927    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  33.18 
 
 		 434 aa  237  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 		 428 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  35.28 
 
 		 419 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  35.6 
 
 		 418 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  32.55 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  32.16 
 
 		 428 aa  217  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  31.41 
 
 		 437 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  34.64 
 
 		 411 aa  209  7e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  34.64 
 
 		 411 aa  209  1e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  35.58 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  34.5 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  31.41 
 
 		 455 aa  200  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 		 464 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  34.79 
 
 		 411 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 439 aa  194  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  31.13 
 
 		 446 aa  192  9e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 		 436 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  32.02 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.77 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  34.29 
 
 		 439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  30.97 
 
 		 421 aa  180  4.999999999999999e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  32.8 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  32.59 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  31.87 
 
 		 421 aa  176  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  31.31 
 
 		 419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  33.42 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  34.66 
 
 		 423 aa  172  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.81 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 		 440 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  30.56 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  31.71 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 		 420 aa  162  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  30.83 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  29.51 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  32.53 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  32.95 
 
 		 522 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  31.51 
 
 		 420 aa  153  5.9999999999999996e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 465 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 465 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 465 aa  153  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  33.13 
 
 		 425 aa  150  4e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  28.32 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  28.04 
 
 		 438 aa  146  8.000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  30.45 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  26.27 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 418 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.8 
 
 		 402 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  30.39 
 
 		 468 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 419 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  26.43 
 
 		 433 aa  128  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 412 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28.17 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.52 
 
 		 521 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 464 aa  120  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  27.91 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 412 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 449 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.37 
 
 		 431 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.01 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.69 
 
 		 454 aa  104  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25.66 
 
 		 416 aa  104  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 724 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  22.81 
 
 		 436 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 415 aa  97.1  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.07 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.23 
 
 		 426 aa  94  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 412 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.67 
 
 		 496 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 446 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 429 aa  87.4  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 432 aa  87  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 435 aa  87  7e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 424 aa  83.2  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  21.91 
 
 		 411 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>