226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0960 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 427 aa  857    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  60.29 
 
 		 429 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  58.45 
 
 		 437 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  56.59 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  56.28 
 
 		 434 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  48.58 
 
 		 436 aa  389  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  44.39 
 
 		 464 aa  350  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  43.41 
 
 		 436 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  35.59 
 
 		 423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  32.86 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  32.85 
 
 		 420 aa  202  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.83 
 
 		 402 aa  196  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  30.13 
 
 		 464 aa  190  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  31.28 
 
 		 465 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  35.14 
 
 		 433 aa  186  8e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  31.13 
 
 		 416 aa  182  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  28.88 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  30.34 
 
 		 468 aa  170  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 428 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 411 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  27.14 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 411 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 420 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.32 
 
 		 421 aa  100  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  27.13 
 
 		 453 aa  99.8  9e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 455 aa  98.2  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 		 436 aa  97.4  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 422 aa  97.4  4e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 428 aa  96.7  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 414 aa  96.3  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.01 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 425 aa  94.4  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 425 aa  94  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.51 
 
 		 418 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  24.32 
 
 		 421 aa  89.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  22.69 
 
 		 422 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25.95 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  21.84 
 
 		 440 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 412 aa  87.4  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 447 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 430 aa  86.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.22 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  23.66 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 522 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  22.64 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.54 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  21.81 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  22.56 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 423 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0459  extracellular solute-binding protein  20.99 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.420805  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  32.43 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.08 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  22.98 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  22.13 
 
 		 431 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.78 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0431  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  21.39 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  21.99 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 426 aa  57  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0158  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 		 435 aa  57  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.317406 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 448 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  21.84 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.21 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.11 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 		 424 aa  55.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1321  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>