235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1095 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 429 aa  857    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  66.99 
 
 		 434 aa  560  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  60.49 
 
 		 427 aa  507  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  60.5 
 
 		 447 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  57.73 
 
 		 437 aa  480  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  51.24 
 
 		 436 aa  421  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  44.55 
 
 		 464 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  44.07 
 
 		 436 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  35.19 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  35.48 
 
 		 400 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  32.26 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  31.4 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  31.92 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 465 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 483 aa  190  4e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.51 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  29.41 
 
 		 468 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 428 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 		 436 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 419 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  26.99 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.95 
 
 		 418 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 428 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 425 aa  102  9e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 411 aa  102  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.11 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.13 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 455 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 439 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 439 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 440 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 421 aa  93.2  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 426 aa  90.5  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 430 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  23.53 
 
 		 446 aa  89.7  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 453 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 447 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.45 
 
 		 454 aa  87  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 437 aa  87  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  24.77 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 424 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 423 aa  79.7  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  23.8 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.34 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.13 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.2 
 
 		 431 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 427 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  23.9 
 
 		 421 aa  67  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  21.81 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 473 aa  66.6  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  23.46 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.18 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  22.05 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0091  ABC sorbitol/mannitol transporter, periplasmic binding protein  22.39 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.126585  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  21.78 
 
 		 466 aa  63.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 419 aa  62.4  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 724 aa  62  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 446 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1727  extracellular solute-binding protein  22.14 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  22.69 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2058  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.617385 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  22.63 
 
 		 514 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  30.82 
 
 		 450 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0848  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 453 aa  57.8  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0413942  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4978  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 437 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  21.71 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  21.88 
 
 		 449 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>