More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_23010 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 436 aa  886    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  60.53 
 
 		 421 aa  521  1e-146  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 		 410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.36 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 		 410 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.32 
 
 		 407 aa  117  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 444 aa  104  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.12 
 
 		 465 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.8 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  21.98 
 
 		 419 aa  99.8  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 429 aa  98.6  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 424 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 412 aa  98.2  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 437 aa  96.3  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 453 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.28 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 411 aa  95.1  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 415 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.06 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 402 aa  94.7  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 473 aa  94  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  22.92 
 
 		 426 aa  93.2  7e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 436 aa  93.2  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.86 
 
 		 431 aa  93.2  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  26.06 
 
 		 440 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 424 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 446 aa  92.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 425 aa  90.9  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 418 aa  90.1  7e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  23.08 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  23.08 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 419 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  23.62 
 
 		 446 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 456 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  27.61 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.03 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 		 410 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 430 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.67 
 
 		 430 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 433 aa  88.2  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0069  twin-arginine translocation pathway signal  23.95 
 
 		 432 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 439 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 439 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 412 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.36 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.13 
 
 		 430 aa  85.9  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.83 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 455 aa  85.9  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.2 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.35 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.78 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.07 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 464 aa  83.2  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.88 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.07 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.29 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 457 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.17 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7337  ABC transporter substrate binding protein  26.56 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.00127436  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 		 411 aa  78.6  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 416 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 414 aa  77.8  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4695  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 432 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.52565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.09 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  22.96 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 		 453 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  23.18 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>