More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2859 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
417 aa  844    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  55.56 
 
 
410 aa  439  9.999999999999999e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  47.23 
 
 
420 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  41.9 
 
 
418 aa  326  6e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06941  ABC-type sugar transport system periplasmic protein  48.03 
 
 
229 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  33 
 
 
452 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  32.69 
 
 
452 aa  199  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  33.08 
 
 
432 aa  192  9e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
424 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  35.09 
 
 
438 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 
442 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7173  sugar transport system (sugar-binding protein)  29.71 
 
 
433 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.119283 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  31.56 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1785  extracellular solute-binding protein family 1  29.49 
 
 
424 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.155279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3308  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  32.55 
 
 
450 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  33.04 
 
 
435 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  30.72 
 
 
434 aa  137  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 
434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  30.19 
 
 
424 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
462 aa  130  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1736  extracellular solute-binding protein family 1  30.15 
 
 
435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 
424 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  29.39 
 
 
434 aa  127  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 
444 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5459  extracellular solute-binding protein  30.85 
 
 
422 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  32.87 
 
 
446 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 
428 aa  123  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  29.18 
 
 
437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 
428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6282  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 
433 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06942  hypothetical protein  43.04 
 
 
157 aa  117  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  28.61 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1891  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.276259 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 
431 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 
424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.49 
 
 
449 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
445 aa  110  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 
421 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
424 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.92 
 
 
449 aa  103  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 
457 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1957  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
446 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000130159  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0399  extracellular solute-binding protein family 1  28.95 
 
 
430 aa  101  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2399  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 
433 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275508 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.11 
 
 
450 aa  100  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.99 
 
 
447 aa  98.2  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 
456 aa  96.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
467 aa  95.9  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08420  carbohydrate-binding protein  26.65 
 
 
438 aa  94  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.837516  normal  0.172242 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  27.36 
 
 
434 aa  90.9  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.39 
 
 
458 aa  90.5  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2837  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 
441 aa  90.5  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0236558  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.63 
 
 
453 aa  90.1  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1882  extracellular solute-binding protein family 1  26.74 
 
 
446 aa  90.1  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.822809 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 
504 aa  88.6  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 
430 aa  87.4  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  26.39 
 
 
430 aa  87  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 
421 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 
429 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1435  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.19 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0110058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 
421 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 
480 aa  83.2  0.000000000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2611  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 
450 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606136  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.22 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  32.26 
 
 
449 aa  75.1  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 
425 aa  74.3  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  23.12 
 
 
438 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.76 
 
 
426 aa  72.8  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 
445 aa  72.8  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 
446 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0751  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0314212  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 
450 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 
411 aa  69.7  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  21.97 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.8 
 
 
444 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2112  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 
449 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0884714  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 
455 aa  67.4  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  25.43 
 
 
418 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 
428 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 
437 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 
420 aa  65.1  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.59 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  23.29 
 
 
420 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 
415 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  20.19 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 
422 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 
415 aa  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 
421 aa  63.5  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>