More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0690 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 402 aa  819    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 415 aa  169  6e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 		 399 aa  162  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  30.68 
 
 		 423 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 		 414 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  26.95 
 
 		 434 aa  142  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  28.39 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 		 415 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 424 aa  135  9e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.85 
 
 		 411 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.45 
 
 		 366 aa  132  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.82 
 
 		 403 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 		 486 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 		 504 aa  124  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 		 421 aa  123  5e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 417 aa  123  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  26.58 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  28.19 
 
 		 443 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  26.41 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 430 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  25 
 
 		 430 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.21 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 		 410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 410 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.69 
 
 		 440 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5213  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 415 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.506772 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  27.42 
 
 		 407 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5476  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 415 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.487316 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.46 
 
 		 426 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.95 
 
 		 430 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.83 
 
 		 457 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.95 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 427 aa  101  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  21.62 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.95 
 
 		 437 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 		 437 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 415 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 409 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.58 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1023  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.705733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 426 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 466 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.7 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 461 aa  96.3  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.85 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 436 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.35 
 
 		 438 aa  94  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  23.26 
 
 		 439 aa  93.2  7e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 425 aa  93.2  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  28.34 
 
 		 428 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  22.39 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  22.39 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 435 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 420 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 411 aa  89.7  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 411 aa  89.7  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  26.14 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3956  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.99 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal  0.0187852 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 421 aa  88.6  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.81 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 437 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 492 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 466 aa  87.4  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  22.65 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>