More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4057 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  89.73 
 
 
410 aa  744    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  89 
 
 
410 aa  756    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
410 aa  834    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  60.42 
 
 
411 aa  474  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  60.16 
 
 
411 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  60.29 
 
 
366 aa  435  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 
424 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  29.64 
 
 
411 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.14 
 
 
406 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 
433 aa  159  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 
401 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  29.4 
 
 
410 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.09 
 
 
407 aa  155  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 
409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  28.9 
 
 
407 aa  146  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 
399 aa  139  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  27.96 
 
 
424 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 
416 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 
438 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 
411 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 
411 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.57 
 
 
410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.57 
 
 
410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 
459 aa  125  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 
446 aa  123  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 
425 aa  122  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 
420 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.21 
 
 
426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  28.13 
 
 
436 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 
415 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.75 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.9 
 
 
416 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 
410 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  27.9 
 
 
416 aa  116  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  29.06 
 
 
504 aa  116  6e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.68 
 
 
422 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.61 
 
 
416 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 
466 aa  116  8.999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
430 aa  116  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 
410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 
410 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  25.43 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 
427 aa  114  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  28.77 
 
 
453 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 
428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 
432 aa  111  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 
429 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
402 aa  110  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 
416 aa  109  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 
412 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 
430 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 
427 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
406 aa  107  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
420 aa  107  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.23 
 
 
406 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.71 
 
 
431 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 
420 aa  107  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 
453 aa  106  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 
412 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
435 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 
419 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  26.18 
 
 
426 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 
459 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 
420 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
461 aa  103  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  23.22 
 
 
428 aa  102  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  22.56 
 
 
434 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 
432 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
436 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 
436 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 
421 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 
414 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
412 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 
456 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 
439 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  26.34 
 
 
403 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 
442 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
420 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 
414 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 
417 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
426 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 
444 aa  99.8  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 
442 aa  99.8  8e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 
421 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.81 
 
 
422 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  23.73 
 
 
423 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 
428 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 
410 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
486 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 
419 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 
432 aa  97.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
437 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.09 
 
 
437 aa  97.1  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>