More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6631 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  79.06 
 
 		 407 aa  636    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 410 aa  834    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  96.51 
 
 		 401 aa  793    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  78.05 
 
 		 409 aa  665    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  30.53 
 
 		 411 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.05 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  28.89 
 
 		 410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 411 aa  136  5e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  27.97 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.17 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 424 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.27 
 
 		 407 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.74 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.74 
 
 		 410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 411 aa  110  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 		 411 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 436 aa  109  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 416 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 444 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.24 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 431 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 407 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.57 
 
 		 403 aa  101  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 431 aa  100  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2057  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112802  normal  0.296802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 		 435 aa  96.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 420 aa  95.5  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 421 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.46 
 
 		 413 aa  94  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4733  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  27.36 
 
 		 458 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2535  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 418 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.105932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 416 aa  93.2  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0606  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  27.36 
 
 		 458 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  31.08 
 
 		 492 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 441 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 445 aa  92  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 423 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0480  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  27.03 
 
 		 458 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0482  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  27.03 
 
 		 458 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0625  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  27.03 
 
 		 458 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 419 aa  90.1  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0700  putative glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein  24.48 
 
 		 458 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 425 aa  90.1  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 415 aa  89.7  8e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0632  glycerol-3-phosphate ABC transporter, glycerol-3-phosphate-binding protein, putative  26.69 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0538  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  26.69 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0569  glycerol-3-phosphate ABC transporter glycerol-3-phosphate-binding protein  26.69 
 
 		 458 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 448 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.87 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4022  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 431 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0655  glycerol-3-phosphate ABC transporter, periplasmic glycerol-3-phosphate-binding protein  28.42 
 
 		 433 aa  89  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.454035  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3290  ABC glycerol-3-phosphate transporter, periplasmic binding protein, UgpB  30.08 
 
 		 431 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  28.48 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3285  hypothetical protein  28.91 
 
 		 431 aa  87.8  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3750  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 		 433 aa  87.4  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316129  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  27.1 
 
 		 458 aa  87.4  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 411 aa  87  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 		 413 aa  86.7  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 421 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 		 437 aa  86.3  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1895  extracellular solute-binding protein  28.05 
 
 		 445 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  28.33 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2663  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  22.42 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4045  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 439 aa  84  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.661181  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 443 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 455 aa  83.2  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 504 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2845  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 439 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  25.91 
 
 		 421 aa  82.8  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>