More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1991 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  76.87 
 
 
446 aa  644    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
455 aa  927    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  66.51 
 
 
439 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  72.98 
 
 
436 aa  553  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  39.21 
 
 
428 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  35.54 
 
 
437 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  38.86 
 
 
414 aa  259  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 
411 aa  256  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  38.96 
 
 
411 aa  256  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 
425 aa  246  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  38.23 
 
 
411 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  36.08 
 
 
413 aa  237  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 
421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  34.72 
 
 
428 aa  222  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  35.07 
 
 
466 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  35.37 
 
 
464 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  35.11 
 
 
419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
428 aa  216  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.75 
 
 
418 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  35.13 
 
 
422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  30.63 
 
 
434 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 
439 aa  197  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 
453 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  34.38 
 
 
423 aa  196  6e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  36.93 
 
 
423 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  32.48 
 
 
440 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  35.31 
 
 
522 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.8 
 
 
421 aa  190  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 
423 aa  189  8e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  32.58 
 
 
447 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 
419 aa  186  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  33.16 
 
 
421 aa  186  7e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  30.11 
 
 
422 aa  186  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  34.32 
 
 
430 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  32.15 
 
 
421 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  35.75 
 
 
425 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  33.89 
 
 
424 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  31.59 
 
 
426 aa  176  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.15 
 
 
424 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  32.48 
 
 
420 aa  173  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
412 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  30.59 
 
 
412 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  29.52 
 
 
438 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 
412 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 
363 aa  157  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  29.67 
 
 
433 aa  156  8e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  29.38 
 
 
431 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  29.28 
 
 
421 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 
433 aa  149  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  28.64 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  28.78 
 
 
420 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  30.66 
 
 
418 aa  147  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
433 aa  146  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.07 
 
 
402 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 
444 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
416 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 
419 aa  141  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  28.98 
 
 
435 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 
436 aa  139  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 
433 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  30.74 
 
 
412 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.17 
 
 
426 aa  136  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  28.13 
 
 
423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 
415 aa  134  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 
437 aa  133  6.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
424 aa  130  6e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
399 aa  126  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 
400 aa  126  8.000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 
449 aa  126  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 
464 aa  123  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 
465 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 
419 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 
483 aa  115  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.99 
 
 
454 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 
416 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.13 
 
 
436 aa  109  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
429 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 
426 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 
514 aa  107  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 
437 aa  106  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03700  carbohydrate-binding protein  30.37 
 
 
464 aa  106  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.05 
 
 
407 aa  105  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  23.46 
 
 
468 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 
436 aa  103  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 
441 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0547  ABC-type sugar / sn-glycerol 3-phosphate transport protein  27.55 
 
 
447 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 
427 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.59 
 
 
496 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.38 
 
 
434 aa  101  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
464 aa  100  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
427 aa  100  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 
416 aa  99.8  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
410 aa  99.8  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 
446 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 
461 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  23.36 
 
 
429 aa  98.2  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 
412 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>