131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0753 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 		 454 aa  925    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.1 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  29.7 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  29.4 
 
 		 428 aa  159  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  28.51 
 
 		 434 aa  153  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  32.06 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.31 
 
 		 521 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  32.07 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 455 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.68 
 
 		 448 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  26.93 
 
 		 724 aa  110  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  25.56 
 
 		 421 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  27.15 
 
 		 446 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 		 437 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 440 aa  106  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  26.19 
 
 		 436 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.65 
 
 		 433 aa  99.8  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.42 
 
 		 425 aa  94.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  24.5 
 
 		 422 aa  93.2  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.54 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 424 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 411 aa  87.4  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 		 421 aa  87.4  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  28.17 
 
 		 438 aa  86.7  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 423 aa  86.7  9e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.08 
 
 		 414 aa  86.3  0.000000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.76 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 416 aa  85.9  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 427 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.21 
 
 		 421 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  24.42 
 
 		 468 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 466 aa  74.3  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.26 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 423 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.27 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  21.85 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  21.11 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  21.67 
 
 		 412 aa  66.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  23.41 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 419 aa  64.3  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  22.71 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 412 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 514 aa  58.5  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  21.43 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  22.03 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  22.83 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  20.94 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2119  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 511 aa  54.7  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  21.33 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  21.87 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  22.73 
 
 		 426 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4357  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.200959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4443  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0226595 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0572  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 470 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  22.28 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3999  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.220113  normal  0.250177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.4 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.696543 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>