119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9021 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 521 aa  1061    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  33.98 
 
 		 419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  32.29 
 
 		 418 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.31 
 
 		 454 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  32.62 
 
 		 428 aa  140  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  29.07 
 
 		 724 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  30.33 
 
 		 434 aa  127  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  30.33 
 
 		 426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  30.52 
 
 		 453 aa  120  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 428 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 439 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 437 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 436 aa  103  7e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  29.94 
 
 		 448 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  26.89 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 433 aa  101  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 425 aa  99.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.23 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  26.41 
 
 		 446 aa  97.8  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 464 aa  97.1  8e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 466 aa  96.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.3 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 413 aa  93.2  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 424 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  25.75 
 
 		 421 aa  91.3  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  26.19 
 
 		 430 aa  90.9  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 439 aa  90.9  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 423 aa  89.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 455 aa  87  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.08 
 
 		 421 aa  83.6  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 419 aa  83.2  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  24.04 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 437 aa  81.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  23.88 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0011  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 473 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0936464  normal  0.0312936 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  23.87 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2544  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3851  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0718166 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  26 
 
 		 400 aa  77  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 414 aa  76.6  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  23.61 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1199  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.420226  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  21.55 
 
 		 412 aa  69.7  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.43 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 435 aa  67  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3983  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.07 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3683  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.6 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.48952  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  23.43 
 
 		 496 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 439 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 439 aa  55.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.75 
 
 		 426 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  22.19 
 
 		 522 aa  55.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 412 aa  55.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 429 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 514 aa  53.9  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  23.55 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  22.92 
 
 		 451 aa  53.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 430 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  23.24 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 419 aa  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  23.3 
 
 		 426 aa  52  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 433 aa  50.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 390 aa  50.8  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11260  lipoprotein (sugar-binding) lpqY  22.78 
 
 		 468 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432408 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03790  maltose-binding periplasmic protein  21.78 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0386362 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  21.61 
 
 		 411 aa  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  36.51 
 
 		 432 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1179  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.69 
 
 		 423 aa  47.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0916647  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 		 446 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 412 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6665  extracellular solute-binding protein  32.67 
 
 		 423 aa  47.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  25.34 
 
 		 434 aa  47  0.0008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  20.71 
 
 		 412 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2064  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  21.68 
 
 		 366 aa  46.2  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>