More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20870 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
430 aa  880    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  55.73 
 
 
419 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  52.88 
 
 
439 aa  412  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  51.46 
 
 
422 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  50.36 
 
 
423 aa  402  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  50.63 
 
 
421 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  51.36 
 
 
423 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  46.63 
 
 
424 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  48.07 
 
 
421 aa  391  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  45.91 
 
 
424 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  49.49 
 
 
423 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  49.6 
 
 
421 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  46.82 
 
 
425 aa  364  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  43.33 
 
 
420 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0397  extracellular solute-binding protein family 1  43.04 
 
 
522 aa  316  4e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  42.78 
 
 
421 aa  308  8e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 
411 aa  291  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  40.15 
 
 
411 aa  291  1e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 
413 aa  290  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  40.48 
 
 
411 aa  286  7e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  39.36 
 
 
414 aa  280  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  40.16 
 
 
428 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  37.38 
 
 
437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  39.89 
 
 
419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  35.13 
 
 
418 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  34.32 
 
 
455 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  31.77 
 
 
464 aa  184  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  30.99 
 
 
418 aa  182  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
439 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  31.23 
 
 
466 aa  178  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 
428 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  33.06 
 
 
428 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0138  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 
412 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 
419 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  33.07 
 
 
434 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 
436 aa  168  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  31.71 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  30.41 
 
 
446 aa  164  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 
440 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0950  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  31.76 
 
 
438 aa  161  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  30.83 
 
 
436 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 
426 aa  150  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 
363 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15281  ABC transporter for sugars, solute-binding protein  27.05 
 
 
422 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.493249 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1408  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  27.29 
 
 
421 aa  137  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.590186  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1697  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 
447 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00303465  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 
420 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1331  extracellular solute-binding protein family 1  30.71 
 
 
448 aa  123  8e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000205805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
412 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1078  ABC transporter, likely sugar solute binding protein  24.75 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4617  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 
433 aa  120  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0699008  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0282  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 
423 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 
412 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
416 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  29.41 
 
 
412 aa  113  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  30.34 
 
 
439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1041  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 
416 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.172945  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  26.82 
 
 
419 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 
419 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4644  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 
400 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0101413 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.03 
 
 
402 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1855  extracellular solute-binding protein family 1  27.74 
 
 
441 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0869  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 
444 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509231  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  28.87 
 
 
437 aa  97.4  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 
419 aa  97.1  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 
437 aa  93.2  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3610  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 
724 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9021  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.19 
 
 
521 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  26.98 
 
 
430 aa  90.1  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1095  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 
429 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0142627  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0753  putative ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  25.89 
 
 
454 aa  89.4  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0836002  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2264  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 
514 aa  89  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337461  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
436 aa  87.4  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0013  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 
511 aa  86.7  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.957035  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  24.02 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0960  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226879  hitchhiker  0.000138332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3934  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 
447 aa  84  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.486973  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3775  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal  0.394592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 
411 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.84 
 
 
436 aa  82.4  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2624  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
444 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 
458 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
424 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
424 aa  81.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2482  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0758562  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 
454 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.48 
 
 
439 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.35 
 
 
431 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.93 
 
 
439 aa  79  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.39 
 
 
452 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 
414 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1866  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
464 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4057  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.755308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3997  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.110997  normal  0.433481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>