More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7049 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
439 aa  899    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  58.74 
 
 
513 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2901  extracellular solute-binding protein family 1  59.03 
 
 
425 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  47.96 
 
 
419 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  48.76 
 
 
419 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
428 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0258  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 
419 aa  124  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
428 aa  123  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  31 
 
 
411 aa  123  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  31 
 
 
411 aa  122  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  27.79 
 
 
421 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 
433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
424 aa  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_011899  Hore_20870  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  30.63 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  28.15 
 
 
423 aa  110  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
423 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
414 aa  106  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 
423 aa  103  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
421 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4442  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
425 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00539632  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.6 
 
 
421 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
408 aa  97.1  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 
411 aa  97.4  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3399  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 
440 aa  96.7  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0250918  normal  0.750741 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2821  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 
428 aa  95.5  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.858803  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3146  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 
439 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.654082  normal  0.268339 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0025  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
422 aa  93.2  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.669897  normal  0.473652 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 
431 aa  92.8  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.2 
 
 
486 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0939  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.83 
 
 
496 aa  91.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.328419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4158  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
446 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.214678  normal  0.791693 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4682  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 
412 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252692  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 
413 aa  89.7  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0974  extracellular solute-binding protein family 1  29.54 
 
 
435 aa  89.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.606433  normal  0.163223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 
466 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2753  extracellular solute-binding protein family 1  26.75 
 
 
410 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.501272  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0361  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
444 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.678366  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
477 aa  87.8  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 
411 aa  88.2  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 
421 aa  88.2  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
484 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 
424 aa  87.8  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5508  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
412 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3592  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
439 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4775  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 
439 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 
420 aa  87  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4845  extracellular solute-binding protein  26.17 
 
 
434 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.834917  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
425 aa  84.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.08 
 
 
411 aa  84  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  23.81 
 
 
438 aa  83.2  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  26.55 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.27 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.42 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0303  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 
478 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.105454 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 
464 aa  81.3  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 
498 aa  81.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.42 
 
 
439 aa  80.9  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1711  extracellular solute-binding protein family 1  29.75 
 
 
450 aa  80.1  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.827618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 
448 aa  80.1  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5198  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 
442 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.06332 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  27.16 
 
 
438 aa  79.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2707  mannitol ABC transporter, periplasmic mannitol-binding protein  28.24 
 
 
440 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.069342  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
441 aa  79  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  26.8 
 
 
439 aa  79  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 
451 aa  78.6  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0889  extracellular solute-binding protein  23.2 
 
 
435 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.24 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 
436 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 
412 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 
435 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  26.65 
 
 
441 aa  76.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  24.51 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 
422 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1047  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  24.64 
 
 
487 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 
436 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
439 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2796  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 
468 aa  74.3  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2440  extracellular solute-binding protein  27.48 
 
 
440 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0811647  decreased coverage  0.000336324 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5468  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.303073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.5 
 
 
452 aa  73.6  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0633  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 
415 aa  73.2  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  22.62 
 
 
440 aa  73.2  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
455 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1113  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 
437 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.056534  normal  0.199649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>