281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0699 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
443 aa  915    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  69.84 
 
 
441 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6371  extracellular solute-binding protein  69.66 
 
 
443 aa  627  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.970426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  68.28 
 
 
443 aa  629  1e-179  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  42.31 
 
 
436 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  41.59 
 
 
435 aa  361  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 
433 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5939  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 
610 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.06 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
449 aa  96.3  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4211  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 
598 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.64235  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1742  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.67 
 
 
590 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4889  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  24.41 
 
 
596 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2416  extracellular solute-binding protein  27.15 
 
 
577 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000012875  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1898  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
579 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.477877  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1738  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
579 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.217891 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  23.7 
 
 
484 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3735  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.36 
 
 
590 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217509  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1367  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
595 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15999  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  23.14 
 
 
484 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0375  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 
574 aa  90.5  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812044  normal  0.244045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1445  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
579 aa  90.5  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779886  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 
419 aa  90.1  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4063  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 
599 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.159076  normal  0.524387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2227  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  25.21 
 
 
580 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272484  normal  0.0425945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2264  extracellular solute-binding protein, family 1  26.07 
 
 
579 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.864304  decreased coverage  0.00109234 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1597  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
573 aa  89.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3473  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
579 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.971584  hitchhiker  0.00076059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2047  extracellular solute-binding protein  26.07 
 
 
580 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120072  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3630  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 
580 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1969  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
588 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386461  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2909  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 
574 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175958  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2089  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
593 aa  86.7  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7049  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0982583  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5372  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 
580 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.737373 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6724  extracellular solute-binding protein family 1  28.52 
 
 
580 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  21.92 
 
 
536 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 
428 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2229  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 
580 aa  83.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0301867  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3982  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 
573 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.227864  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0100  hypothetical protein  23.06 
 
 
574 aa  81.6  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0356789  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2986  putative signal peptide protein  26.38 
 
 
581 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9075  hypothetical protein  24.67 
 
 
558 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3051  putative signal peptide protein  26.16 
 
 
580 aa  80.9  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0886733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3169  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  25.9 
 
 
573 aa  80.9  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000122164  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3333  conserved hypothetical signal peptide protein  26.16 
 
 
578 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.9 
 
 
486 aa  80.1  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2204  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 
579 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4098  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
569 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00991271  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3127  sugar ABC transporter  26.12 
 
 
579 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5977  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.02 
 
 
574 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0609  extracellular solute-binding protein  26.33 
 
 
577 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348028  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1030  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 
577 aa  77.8  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 
484 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6464  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.01 
 
 
574 aa  76.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
436 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0381  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
577 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000205955  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 
513 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0389  extracellular solute-binding protein  29.07 
 
 
577 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.83487  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  22.12 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25 
 
 
422 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 
424 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25 
 
 
422 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
422 aa  73.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4181  extracellular solute-binding protein  23.79 
 
 
435 aa  72.8  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000770865  normal  0.668736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3391  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
577 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285234  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3671  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
577 aa  72.4  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00462233  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1918  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.49 
 
 
573 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000332483  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 
447 aa  71.6  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.96 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0483  twin-arginine translocation pathway signal  25.71 
 
 
579 aa  70.9  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00131469  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 
451 aa  70.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2095  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.15 
 
 
569 aa  70.1  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.105917 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2317  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
577 aa  70.1  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000660046  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3348  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 
443 aa  70.1  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 
410 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.43 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.43 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  22.72 
 
 
437 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 
437 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  22.41 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  22.41 
 
 
410 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.89 
 
 
439 aa  67  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 
424 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.76 
 
 
411 aa  67  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
461 aa  66.6  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.97 
 
 
439 aa  66.6  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  23.7 
 
 
403 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1756  ABC transporter substrate-binding protein  25.49 
 
 
439 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.887651  normal  0.574192 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1201  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 
572 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.487559  normal  0.842714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>