More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1420 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
424 aa  870    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  33.42 
 
 
411 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  33.51 
 
 
411 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  32.68 
 
 
410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  34.45 
 
 
411 aa  222  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  32.75 
 
 
410 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  33.14 
 
 
366 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 
410 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 
433 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.04 
 
 
406 aa  166  9e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
399 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 
453 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.74 
 
 
428 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 
414 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  28.18 
 
 
427 aa  138  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 
412 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  28.46 
 
 
428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 
412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.37 
 
 
407 aa  133  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
415 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 
419 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
410 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  28.6 
 
 
429 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 
421 aa  129  9.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.56 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.14 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 
459 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 
401 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
423 aa  125  1e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
410 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 
484 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 
422 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 
435 aa  123  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  27.08 
 
 
406 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6090  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 
425 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 
456 aa  122  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.83 
 
 
431 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 
427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 
446 aa  120  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 
420 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 
437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
461 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 
443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
421 aa  117  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 
430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  23.23 
 
 
432 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
450 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 
445 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.75 
 
 
410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.75 
 
 
410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  26.15 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.63 
 
 
430 aa  114  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0772443  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
443 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  24.53 
 
 
434 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3553  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
419 aa  113  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0958946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 
424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  26.62 
 
 
403 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.27 
 
 
431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1090  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 
436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.667729  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  29.2 
 
 
410 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 
455 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  24.93 
 
 
430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
422 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.34 
 
 
422 aa  110  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 
420 aa  110  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.37 
 
 
438 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  27.44 
 
 
424 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.05 
 
 
422 aa  110  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
411 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  22.07 
 
 
432 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  26.04 
 
 
409 aa  109  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.32 
 
 
416 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  24.6 
 
 
407 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.23 
 
 
416 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 
430 aa  109  1e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
466 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  24.01 
 
 
440 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 
423 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 
443 aa  108  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 
405 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 
421 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 
441 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 
435 aa  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.14 
 
 
416 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2977  extracellular solute-binding protein family 1  30.34 
 
 
415 aa  107  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  28.17 
 
 
414 aa  107  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  23.76 
 
 
423 aa  107  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 
447 aa  106  6e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 
404 aa  107  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0323  family 1 extracellular solute-binding protein  22.09 
 
 
432 aa  106  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 
425 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
433 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  23.75 
 
 
409 aa  106  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  28.12 
 
 
426 aa  106  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>