More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  100 
 
 		 419 aa  832    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  39.04 
 
 		 421 aa  242  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  32.33 
 
 		 414 aa  232  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1548  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.48 
 
 		 438 aa  192  6e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.00000392798  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  32.97 
 
 		 425 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  28.77 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 461 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 420 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.74 
 
 		 407 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 441 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 		 420 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 		 447 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  29.62 
 
 		 410 aa  107  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  26.73 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  26.73 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  26.16 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  23.71 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.33 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  28.03 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  24.29 
 
 		 408 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4488  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 434 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.395657  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 415 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0475  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 397 aa  99.8  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  27.45 
 
 		 442 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 445 aa  99  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.45 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 410 aa  98.6  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 445 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 411 aa  98.2  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 422 aa  97.8  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 420 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 421 aa  97.1  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0791  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 399 aa  96.3  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06340  maltose-binding periplasmic protein  31.08 
 
 		 409 aa  95.9  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.211092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  28.91 
 
 		 456 aa  96.3  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0178  extracellular solute-binding protein family 1  30.07 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 419 aa  94.7  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 429 aa  95.1  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.99 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.11 
 
 		 431 aa  94.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  28.02 
 
 		 436 aa  94.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2714  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 419 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182746  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 456 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 417 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 420 aa  94  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 404 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 392 aa  93.2  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 454 aa  93.2  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 444 aa  92.8  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.65 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 		 411 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  27.72 
 
 		 392 aa  92.8  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  30.48 
 
 		 466 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.3 
 
 		 416 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  28.17 
 
 		 416 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  27.91 
 
 		 416 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  30.17 
 
 		 421 aa  90.9  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.87 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 447 aa  90.5  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 437 aa  90.1  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1068  extracellular solute-binding protein  25.4 
 
 		 429 aa  90.5  6e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.501776  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 416 aa  90.1  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4138  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.78 
 
 		 419 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00348898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 435 aa  89.7  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 437 aa  89.7  9e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4119  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.62 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000674051  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.06 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.06 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 437 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 460 aa  89  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.04 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 424 aa  89  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3922  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  25.87 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0134813  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3754  maltose-maltodextrin ABC-related solute binding protein  25.56 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000542287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3770  maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.87 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000087749  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4229  maltosaccharide ABC transporter maltosaccharide-binding protein  25.87 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.749727  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4032  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.87 
 
 		 419 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1524  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 439 aa  87.4  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 437 aa  87.4  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>