More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0803 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 433 aa  874    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  88.45 
 
 		 433 aa  786    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  54.01 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  52.32 
 
 		 431 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  48.06 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  48.34 
 
 		 419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  42.67 
 
 		 426 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1991  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 		 455 aa  150  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.603432  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 429 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  29.65 
 
 		 415 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 439 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 406 aa  124  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  28.7 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 392 aa  123  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  29 
 
 		 392 aa  122  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.14 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0213  twin-arginine translocation pathway signal  29.55 
 
 		 446 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  25.33 
 
 		 440 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.87 
 
 		 406 aa  121  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 461 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 426 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 424 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 		 436 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 391 aa  112  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  27.85 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  27.85 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.06 
 
 		 399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.42 
 
 		 428 aa  111  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 391 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  31.49 
 
 		 426 aa  111  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  31.66 
 
 		 410 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  29.89 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 		 420 aa  107  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  28.2 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 414 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  30.38 
 
 		 416 aa  106  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 395 aa  106  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.31 
 
 		 406 aa  106  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 413 aa  106  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 466 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 424 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.29 
 
 		 439 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  23.44 
 
 		 430 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 		 456 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0712  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.518168  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.21 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  28.09 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 446 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.81 
 
 		 416 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2663  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 		 468 aa  99  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.94 
 
 		 452 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0854  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 398 aa  98.2  2e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.124504  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3685  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  27.84 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2948  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 448 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 445 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 		 441 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.24 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 		 425 aa  97.8  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  25.24 
 
 		 413 aa  96.7  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0298  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 		 486 aa  96.7  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 460 aa  96.3  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  26.02 
 
 		 492 aa  96.3  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 432 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 437 aa  94.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 397 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01810  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.32 
 
 		 415 aa  94.4  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 492 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 432 aa  93.6  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 441 aa  93.6  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5852  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 438 aa  93.2  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 418 aa  93.2  8e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 410 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 424 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  25.73 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1331  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 464 aa  92.4  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5074  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 421 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.41 
 
 		 438 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  23.72 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2364  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 488 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>