More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4863 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  95.12 
 
 		 492 aa  969    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 492 aa  1012    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 411 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.98 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 409 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 401 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 410 aa  97.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 412 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  29.17 
 
 		 407 aa  96.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 433 aa  93.6  8e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 414 aa  93.2  9e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  28.84 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.48 
 
 		 431 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 429 aa  92.4  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 410 aa  92.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.33 
 
 		 410 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.33 
 
 		 410 aa  91.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 427 aa  90.5  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 411 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 410 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.46 
 
 		 407 aa  88.6  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 428 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.85 
 
 		 403 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 		 402 aa  87.4  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.86 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1095  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 530 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  24.62 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.18 
 
 		 435 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 520 aa  81.6  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 441 aa  80.9  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 436 aa  79.7  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  33.02 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  25.13 
 
 		 423 aa  78.2  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.57 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 420 aa  77  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.39 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  25.58 
 
 		 407 aa  76.3  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  20.54 
 
 		 439 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 		 415 aa  76.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 419 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2170  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  26.68 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  23.79 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  30.33 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  26.61 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8464  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.635867  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3703  extracellular solute-binding protein family 1  35.5 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 399 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 449 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0944  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.322748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 404 aa  73.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  22.74 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 504 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.27 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2870  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3752  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  23.3 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3777  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.253936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  28.34 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  22.01 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5738  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.41 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.599702  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  23.63 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.59 
 
 		 444 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  26.6 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4930  extracellular solute-binding protein family 1  31.49 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.265943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  31.14 
 
 		 448 aa  68.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  30.71 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  22.83 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 453 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>