More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3622 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  96.84 
 
 
412 aa  820    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
412 aa  841    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  83.5 
 
 
421 aa  721    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  41.3 
 
 
414 aa  319  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  40.26 
 
 
415 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  34.97 
 
 
417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  34.77 
 
 
429 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 
432 aa  200  3e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 
441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 
415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 
423 aa  125  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  28.61 
 
 
411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 
430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.62 
 
 
426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
410 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 
410 aa  109  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.56 
 
 
410 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.35 
 
 
366 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.74 
 
 
407 aa  107  6e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.35 
 
 
403 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  26.4 
 
 
428 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
411 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 
430 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 
424 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  31.73 
 
 
410 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  31.73 
 
 
410 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  25.33 
 
 
466 aa  98.2  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
429 aa  97.8  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 
441 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4693  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 
457 aa  97.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.363745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.73 
 
 
431 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 
423 aa  96.3  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 
435 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 
415 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2611  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 
453 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.058641  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  27.33 
 
 
455 aa  93.6  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0910  extracellular solute-binding protein family 1  27.8 
 
 
466 aa  93.2  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.764586  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 
443 aa  93.2  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4863  extracellular solute-binding protein family 1  28.84 
 
 
492 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.426159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.62 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 
422 aa  92.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 
415 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3669  extracellular solute-binding protein family 1  29.21 
 
 
492 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 
426 aa  90.5  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 
445 aa  90.1  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 
414 aa  90.1  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.57 
 
 
444 aa  90.1  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 
421 aa  89.4  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 
420 aa  89.4  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 
414 aa  89.4  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 
419 aa  89  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.47 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
464 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 
419 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 
452 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0904  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.85 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00221898  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 
419 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.15 
 
 
447 aa  85.9  0.000000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  26.23 
 
 
444 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 
504 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 
427 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 
428 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 
433 aa  84.7  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 
454 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3240  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 
431 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3168  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 
419 aa  84  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  28.07 
 
 
423 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.06 
 
 
457 aa  84  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 
436 aa  83.2  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 
427 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  27.43 
 
 
439 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0669  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 
439 aa  81.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0601778  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  28.08 
 
 
429 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4883  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.93 
 
 
417 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134037  normal  0.0630481 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  27.47 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  27.47 
 
 
431 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  27.47 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 
424 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 
520 aa  80.5  0.00000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
461 aa  80.1  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 
420 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1095  extracellular solute-binding protein family 1  29.78 
 
 
530 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.64 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0041  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 
460 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  28.12 
 
 
407 aa  79.3  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.19 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  24.64 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>