More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7516 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 452 aa  914    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  42.93 
 
 		 437 aa  342  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  42.93 
 
 		 437 aa  342  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  42.93 
 
 		 437 aa  342  8e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  38.46 
 
 		 443 aa  300  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  39.75 
 
 		 443 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  39.9 
 
 		 428 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  38.06 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.04 
 
 		 443 aa  96.7  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 447 aa  93.6  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  30.66 
 
 		 549 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 567 aa  90.5  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  33.56 
 
 		 510 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  25.4 
 
 		 412 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  30.54 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 415 aa  83.2  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  31.54 
 
 		 509 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  26.71 
 
 		 421 aa  79.7  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0450  extracellular solute-binding protein  31.94 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.308403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.82 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.04 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.92 
 
 		 438 aa  77  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.77 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 		 571 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.1 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.55 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.23 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0188  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  26.55 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3812  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.353807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  23.31 
 
 		 421 aa  73.6  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.08 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 492 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  24.34 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.88 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2977  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.576527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.15 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.91 
 
 		 428 aa  70.5  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2090  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 423 aa  70.1  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000307561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.82 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.25 
 
 		 406 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 419 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.5 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1015  extracellular solute-binding protein family 1  30.84 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.706197  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.59 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  23.52 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  26.1 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 466 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.5 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  25.59 
 
 		 456 aa  67  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.96 
 
 		 520 aa  67  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0591  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0610101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0984  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000118485  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.79 
 
 		 426 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  22.78 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1820  extracellular solute-binding protein  27.44 
 
 		 411 aa  66.6  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.148067  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1138  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 423 aa  65.1  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.443513  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 414 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0966  extracellular solute-binding protein  21.96 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000011003  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  23.44 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  23.16 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  23.49 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1170  extracellular solute-binding protein family 1  23.59 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.441465  normal  0.43389 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 363 aa  63.9  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2459  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.846254  normal  0.585846 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  23.61 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2526  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07450  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.14 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4395  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.87283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>