More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0758 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
443 aa  901    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  43.25 
 
 
437 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  43.25 
 
 
437 aa  370  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  43.25 
 
 
437 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  40.8 
 
 
428 aa  306  3e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  39.62 
 
 
443 aa  297  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  38.7 
 
 
441 aa  295  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  39.8 
 
 
452 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  27.08 
 
 
454 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 
443 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 
567 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1511  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 
424 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
461 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 
447 aa  86.7  7e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  25.06 
 
 
408 aa  86.7  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 
424 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  29.83 
 
 
549 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  24.82 
 
 
408 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 
395 aa  80.1  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.57 
 
 
406 aa  79  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.92 
 
 
426 aa  78.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  29.11 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 
510 aa  77.8  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2194  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.15 
 
 
443 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0954  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 
420 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0970  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 
411 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000309876  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0446  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900099  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2293  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 
425 aa  73.9  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0656119  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.98 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 
413 aa  73.6  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2244  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 
455 aa  73.2  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.846858 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.67 
 
 
419 aa  73.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 
399 aa  73.2  0.000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
466 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2940  extracellular solute-binding protein  25.55 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459152  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1438  extracellular solute-binding protein  23.71 
 
 
400 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000172655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6732  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 
425 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255639  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05214  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.95 
 
 
416 aa  72  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
544 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 
410 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3730  extracellular solute-binding protein family 1  27.62 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163607  normal  0.040318 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0304  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.89 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  27.23 
 
 
459 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  32.06 
 
 
571 aa  70.1  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001328  maltose/maltodextrin ABC transporter substrate binding periplasmic protein MalE  25.98 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 
510 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 
522 aa  67.8  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6904  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000382644  hitchhiker  0.00751503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 
509 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  22.15 
 
 
411 aa  67  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  22.73 
 
 
416 aa  67  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  25.8 
 
 
404 aa  67  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29870  carbohydrate-binding protein  26.84 
 
 
448 aa  66.6  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.2 
 
 
407 aa  66.2  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4472  maltose ABC transporter periplasmic protein  31.11 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  28.63 
 
 
426 aa  66.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.03 
 
 
438 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0174  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 
426 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.396862  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3465  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3687  extracellular solute-binding protein  26 
 
 
453 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 
428 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
421 aa  64.7  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 
437 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 
557 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0378  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.84 
 
 
403 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  19.78 
 
 
415 aa  64.3  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3914  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.84 
 
 
403 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0306  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.84 
 
 
403 aa  63.9  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000110695  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  30.98 
 
 
422 aa  63.9  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
437 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0897  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 
446 aa  63.5  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0316444  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05710  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.04 
 
 
425 aa  63.2  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13799  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3151  extracellular solute-binding protein  23.02 
 
 
426 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.345086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 
427 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 
423 aa  63.2  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3995  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.83 
 
 
396 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0495972  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
420 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.69 
 
 
503 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5151  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 
400 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.385349  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.39 
 
 
406 aa  62.8  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03906  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.83 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3962  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4274  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.83 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  23.03 
 
 
391 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1500  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
393 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5515  maltose ABC transporter periplasmic protein  24.83 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.241432  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.76 
 
 
429 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0940  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.59 
 
 
409 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69507  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03866  hypothetical protein  24.83 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 
428 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  22.92 
 
 
410 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 
441 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0129  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 
426 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>