109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3316 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 509 aa  1035    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  86.67 
 
 		 510 aa  929    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  33.27 
 
 		 522 aa  293  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  34.42 
 
 		 537 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.09 
 
 		 503 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 567 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 510 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6724  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 563 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 492 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.1 
 
 		 552 aa  100  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4040  hypothetical protein  24.6 
 
 		 567 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  24.95 
 
 		 549 aa  90.9  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 561 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 		 441 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 		 544 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  25.2 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05750  hypothetical protein  22.78 
 
 		 568 aa  85.5  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.182981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3336  extracellular solute-binding protein family 1  22.79 
 
 		 537 aa  85.1  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 523 aa  84.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 571 aa  84  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04170  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.05 
 
 		 547 aa  80.5  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.401805  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1609  ABC-type sugar transport system periplasmic component  22.83 
 
 		 557 aa  80.5  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.051709  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  37.6 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  37.6 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  29.14 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10080  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.26 
 
 		 544 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  21.64 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  31.54 
 
 		 452 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 541 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.58 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.62 
 
 		 406 aa  77.4  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 559 aa  77  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 525 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  26.35 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  24.13 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  31.29 
 
 		 428 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1717  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5565  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 552 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.379464  normal  0.358408 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5755  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.65 
 
 		 544 aa  70.1  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.813391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  33.99 
 
 		 551 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 		 531 aa  68.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1579  putative lipoprotein precursor LplA  23.17 
 
 		 552 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.57 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 		 530 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1437  extracellular solute-binding protein family 1  21.9 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.402875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 542 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4682  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 565 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00316141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2170  extracellular solute-binding protein family 1  22.47 
 
 		 532 aa  60.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 482 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1319  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 548 aa  59.3  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.981957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1769  hypothetical protein  27.62 
 
 		 560 aa  58.2  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0593052  normal  0.250375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0130  extracellular solute-binding protein family 1  21.41 
 
 		 561 aa  57  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1708  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 518 aa  56.6  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  21.93 
 
 		 553 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  24.34 
 
 		 420 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  22.76 
 
 		 556 aa  55.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4116  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 447 aa  53.5  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000719407  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 421 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  30.51 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.77 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 585 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.25 
 
 		 526 aa  51.6  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  23.47 
 
 		 477 aa  50.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  21.43 
 
 		 551 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 536 aa  50.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2358  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 557 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  21.11 
 
 		 552 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  28.96 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1723  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 506 aa  48.1  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3567  ABC transporter substrate binding protein (sorbitol)  26.87 
 
 		 439 aa  48.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0915  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 443 aa  47.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0270  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 419 aa  47.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.562219  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 431 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 436 aa  47.4  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3450  extracellular solute-binding protein family 1  26.64 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7725  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  35.71 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2902  extracellular solute-binding protein  27.24 
 
 		 439 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.76 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  21.05 
 
 		 552 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 454 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  26.05 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  26.06 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 419 aa  45.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>