73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0123 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 505 aa  1030    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  36.51 
 
 		 558 aa  270  4e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  32.68 
 
 		 533 aa  191  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  28.05 
 
 		 531 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  26.86 
 
 		 536 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.44 
 
 		 520 aa  127  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 585 aa  124  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 559 aa  123  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 556 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.15 
 
 		 527 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  29.09 
 
 		 549 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 537 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 541 aa  99.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  25.77 
 
 		 553 aa  96.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 566 aa  95.1  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  28.87 
 
 		 530 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 542 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 553 aa  90.5  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  24.95 
 
 		 556 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  22.72 
 
 		 553 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  24.23 
 
 		 551 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 567 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 548 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 537 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  23.56 
 
 		 551 aa  79.3  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 565 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.08 
 
 		 559 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 544 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 510 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 556 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  27.78 
 
 		 567 aa  75.1  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 571 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.9 
 
 		 503 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 573 aa  68.6  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.91 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.76 
 
 		 557 aa  67  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.11 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  25.11 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.33 
 
 		 511 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  23.74 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 		 428 aa  63.2  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2458  extracellular solute-binding protein family 1  22.17 
 
 		 588 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  25.1 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 366 aa  60.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 552 aa  60.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 552 aa  58.9  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  26.55 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  27.61 
 
 		 452 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.95 
 
 		 526 aa  57.8  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 523 aa  57.4  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1466  putative lipoprotein  25.34 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.123804  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  20.17 
 
 		 557 aa  54.3  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0862  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 568 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13000  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.56 
 
 		 239 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.156871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  22.96 
 
 		 569 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 533 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.37 
 
 		 438 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  30.07 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  30.52 
 
 		 441 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 443 aa  49.3  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0829  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 465 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.308126 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  23.51 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 		 522 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 422 aa  43.9  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.75 
 
 		 453 aa  43.5  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>