31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2052 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  73.5 
 
 		 566 aa  880    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 565 aa  1154    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  36.31 
 
 		 548 aa  296  8e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  35.85 
 
 		 556 aa  282  1e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  31.55 
 
 		 558 aa  230  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  29.37 
 
 		 567 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  28.22 
 
 		 573 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  29.69 
 
 		 569 aa  178  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0862  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 568 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  23.99 
 
 		 559 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  24.16 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2458  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 588 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  23.06 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  28.29 
 
 		 553 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.28 
 
 		 559 aa  52  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 552 aa  51.6  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0087  extracellular solute-binding protein  34.15 
 
 		 175 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000254979  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 531 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 536 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2569  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 523 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 		 557 aa  47  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2654  sugar ABC transporter substrate-binding protein  23.76 
 
 		 586 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  22.25 
 
 		 525 aa  45.8  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1188  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 587 aa  44.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  19.72 
 
 		 544 aa  44.7  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0597  extracellular solute-binding protein family 1  20.8 
 
 		 500 aa  44.3  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 541 aa  43.9  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 		 549 aa  43.9  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>