45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2784 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 573 aa  1172    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  43.3 
 
 		 567 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  31.36 
 
 		 569 aa  289  1e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  30.04 
 
 		 556 aa  226  8e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 		 548 aa  223  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2052  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 565 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 558 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.24 
 
 		 527 aa  75.1  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  25.08 
 
 		 505 aa  69.3  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.79 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.43 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 		 585 aa  64.7  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 556 aa  64.7  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  25.07 
 
 		 551 aa  64.7  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2335  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 482 aa  60.5  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  23.87 
 
 		 536 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  20.76 
 
 		 553 aa  57.4  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  22.1 
 
 		 553 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  21.36 
 
 		 557 aa  55.5  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.45 
 
 		 559 aa  54.3  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.09 
 
 		 537 aa  53.5  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 552 aa  51.6  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 523 aa  51.6  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  23.04 
 
 		 542 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  19.92 
 
 		 533 aa  50.8  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2458  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 588 aa  50.8  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 552 aa  50.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 558 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1466  putative lipoprotein  21.75 
 
 		 483 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.123804  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  23.49 
 
 		 551 aa  49.7  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0437  extracellular solute-binding protein family 1  21.5 
 
 		 424 aa  49.3  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000010114  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 525 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3027  extracellular solute-binding protein  22.64 
 
 		 467 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 553 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 531 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1104  hypothetical protein  22.09 
 
 		 467 aa  48.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.229225  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.34 
 
 		 557 aa  47.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1285  hypothetical protein  21.84 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0350392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 		 571 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 544 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1077  extracellular solute-binding protein  21.35 
 
 		 477 aa  43.9  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.182725  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  22.58 
 
 		 522 aa  43.9  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.53 
 
 		 520 aa  43.9  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 549 aa  43.5  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>