61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2330 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2032  extracellular solute-binding protein family 1  63.35 
 
 		 531 aa  654    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 533 aa  1089    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  63.3 
 
 		 486 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.66 
 
 		 556 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  32.68 
 
 		 505 aa  191  4e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  28.11 
 
 		 558 aa  159  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 536 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.41 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 559 aa  104  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 510 aa  101  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2709  extracellular solute-binding protein family 1  32.78 
 
 		 549 aa  97.1  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  32.74 
 
 		 585 aa  91.3  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.76 
 
 		 527 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 548 aa  89.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  21.96 
 
 		 551 aa  81.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3316  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 509 aa  80.9  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.578802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 544 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2091  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00542537  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 556 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  32.82 
 
 		 567 aa  75.5  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 542 aa  72  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1252  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 571 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.670255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 557 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 523 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0341  extracellular solute-binding protein  32.11 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 558 aa  63.9  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  41.56 
 
 		 452 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  23.77 
 
 		 553 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0145  extracellular solute-binding protein family 1  29.18 
 
 		 530 aa  61.2  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.6 
 
 		 537 aa  60.5  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0482  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00268905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  23.95 
 
 		 569 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0698  extracellular solute-binding protein family 1  35.85 
 
 		 428 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0317884  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  20.77 
 
 		 526 aa  59.3  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.39 
 
 		 544 aa  59.3  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 553 aa  59.3  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1990  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 366 aa  58.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  29.06 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3240  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3709  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 437 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4016  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.43 
 
 		 437 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3575  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  27.43 
 
 		 437 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29210  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.43 
 
 		 503 aa  54.7  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 553 aa  53.5  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  23 
 
 		 525 aa  51.6  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  21.27 
 
 		 556 aa  51.6  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  23.11 
 
 		 566 aa  50.8  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.73 
 
 		 511 aa  50.4  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0758  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 		 443 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  20.44 
 
 		 573 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2733  extracellular solute-binding protein  25.43 
 
 		 533 aa  47.8  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000105202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2458  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 		 588 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  20.59 
 
 		 552 aa  47.8  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0087  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 175 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000254979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  21.74 
 
 		 567 aa  47  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1293  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.74 
 
 		 564 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.719816 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  20.87 
 
 		 551 aa  45.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1549  hypothetical protein  22.48 
 
 		 595 aa  44.3  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0768704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>