79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2399 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2399  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 553 aa  1134    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000923736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2998  extracellular solute-binding protein family 1  54.39 
 
 		 552 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.58673  normal  0.432395 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33170  carbohydrate-binding protein  52.42 
 
 		 551 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0165973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3323  extracellular solute-binding protein family 1  52.15 
 
 		 552 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.023879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1979  extracellular solute-binding protein family 1  47.93 
 
 		 542 aa  529  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1561  sugar ABC transporter periplasmic component-like protein  47.73 
 
 		 553 aa  524  1e-147  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0369  extracellular solute-binding protein family 1  45.17 
 
 		 556 aa  462  1e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3821  extracellular solute-binding protein family 1  42.63 
 
 		 553 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.0761262 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1580  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.62 
 
 		 544 aa  425  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  44.57 
 
 		 559 aa  422  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.497394  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  41.22 
 
 		 556 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01630  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  40.34 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2662  hypothetical protein  38.01 
 
 		 557 aa  348  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2654  sugar ABC transporter substrate-binding protein  32.09 
 
 		 586 aa  280  3e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1118  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 541 aa  210  6e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000575789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0487  extracellular solute-binding protein  24.36 
 
 		 558 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0426  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 536 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0123  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 505 aa  90.9  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1101  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 567 aa  89.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2378  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 486 aa  79  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0763  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.15 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.34388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1016  extracellular solute-binding protein family 1  21.01 
 
 		 585 aa  77  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2193  extracellular solute-binding protein  21.26 
 
 		 557 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0931  extracellular solute-binding protein  22.8 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0552135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0395  extracellular solute-binding protein  21.8 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3388  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0775  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 523 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.062981  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1870  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.440802  normal  0.959587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0150  extracellular solute-binding protein family 1  21.68 
 
 		 567 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0663  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.11 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000120034  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17890  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.16 
 
 		 527 aa  62  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0948  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 		 525 aa  61.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000245196  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0849  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 558 aa  57  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.206456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 459 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0279  extracellular solute-binding protein family 1  20 
 
 		 510 aa  56.2  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.795384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 424 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12990  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.42 
 
 		 511 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.232436  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13590  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.89 
 
 		 552 aa  55.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.080698  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3114  extracellular solute-binding protein family 1  22.48 
 
 		 510 aa  54.7  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0512  extracellular solute-binding protein  26.24 
 
 		 423 aa  54.3  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00024476  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0847  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 		 556 aa  53.5  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2330  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 533 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2784  extracellular solute-binding protein family 1  21.16 
 
 		 573 aa  53.5  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5099  extracellular solute-binding protein family 1  25.87 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.291523  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  22.26 
 
 		 425 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2029  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.58 
 
 		 526 aa  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3210  putative multiple sugar transport system substrate-binding protein  23.82 
 
 		 569 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000204614  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 434 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 417 aa  51.2  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0409  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 561 aa  50.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.665828  normal  0.0938708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02830  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.15 
 
 		 537 aa  50.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.161796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0058  extracellular solute-binding protein, family 1  32.52 
 
 		 551 aa  49.3  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.182513 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.68 
 
 		 453 aa  49.3  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.03 
 
 		 408 aa  48.5  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  27.16 
 
 		 438 aa  48.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 435 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1711  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.795485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  23.48 
 
 		 414 aa  46.2  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2554  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00103966  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.89 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.89 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 422 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0310  extracellular solute-binding protein family 1  20.69 
 
 		 566 aa  45.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3674  ABC sugar transporter, periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 404 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3409  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 404 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280364  normal  0.614723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  22.56 
 
 		 427 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 		 421 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 441 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 452 aa  43.9  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.49 
 
 		 451 aa  43.9  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.41 
 
 		 434 aa  43.5  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  21.95 
 
 		 420 aa  43.5  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  28.44 
 
 		 422 aa  43.5  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 439 aa  43.5  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>