More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2391 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
422 aa  868    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  47.97 
 
 
417 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  47.09 
 
 
408 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  43.69 
 
 
408 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  41.42 
 
 
408 aa  343  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  40.77 
 
 
410 aa  328  8e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  41.77 
 
 
419 aa  311  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  40.79 
 
 
420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  40.79 
 
 
420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  41.52 
 
 
419 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  41.52 
 
 
419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  40.76 
 
 
419 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  40.95 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  40.24 
 
 
417 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  39.34 
 
 
414 aa  299  6e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  40.45 
 
 
421 aa  299  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  40.2 
 
 
413 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  40.2 
 
 
399 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  37.8 
 
 
414 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 
412 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 
412 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  38.22 
 
 
412 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  39.32 
 
 
412 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  34.84 
 
 
441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  36.88 
 
 
420 aa  258  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.1 
 
 
380 aa  256  8e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  37.47 
 
 
424 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  36.5 
 
 
446 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  36.84 
 
 
424 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  34.17 
 
 
432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  32.74 
 
 
427 aa  216  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  36.3 
 
 
445 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  33.17 
 
 
445 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  30.95 
 
 
438 aa  199  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  34.05 
 
 
445 aa  199  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 
631 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 
431 aa  124  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  29.51 
 
 
495 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 
414 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.18 
 
 
427 aa  114  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 
441 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  28.9 
 
 
415 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 
435 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
452 aa  103  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 
439 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 
454 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  28.2 
 
 
414 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 
422 aa  97.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 
435 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
412 aa  96.3  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 
455 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
427 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 
435 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.04 
 
 
434 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 
468 aa  93.6  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 
423 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 
435 aa  92.8  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 
442 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.28 
 
 
436 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 
420 aa  92  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  26.32 
 
 
429 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 
422 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  25.85 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 
411 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  23.24 
 
 
448 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
419 aa  90.1  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 
420 aa  90.1  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 
412 aa  90.1  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  24.5 
 
 
411 aa  89.7  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 
441 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  23.36 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.01 
 
 
412 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  29.19 
 
 
420 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  27.35 
 
 
422 aa  88.2  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 
425 aa  88.2  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 
415 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 
412 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 
450 aa  87.8  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  28.71 
 
 
420 aa  87  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  24.53 
 
 
439 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 
415 aa  87  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 
433 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  27 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  26.76 
 
 
424 aa  86.3  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.58 
 
 
423 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 
427 aa  85.5  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 
466 aa  84.7  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  23.08 
 
 
437 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 
431 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 
419 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  27.15 
 
 
420 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  23.85 
 
 
431 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 
442 aa  84  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  26.52 
 
 
441 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  25.2 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>