More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1588 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 452 aa  907    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  61.7 
 
 		 422 aa  503  1e-141  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  35.49 
 
 		 419 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  23.68 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 408 aa  97.4  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 408 aa  96.7  7e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 412 aa  94.7  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.01 
 
 		 380 aa  93.6  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 415 aa  91.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  27.12 
 
 		 468 aa  89  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 421 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 420 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 420 aa  87  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 414 aa  87  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 419 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 419 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  24.08 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 431 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  23.68 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.91 
 
 		 434 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  23.23 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 		 417 aa  78.2  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  22.72 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 429 aa  76.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 466 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.51 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  26.87 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  24.19 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  25.16 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.87 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.02 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  22.72 
 
 		 485 aa  70.1  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  23.99 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 441 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  21.51 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  23.21 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.76 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 		 445 aa  67  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 439 aa  67  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  24.7 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 451 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  25.16 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 440 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.6 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 429 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.74 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  22.08 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.66 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 		 433 aa  63.9  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  24.66 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0255  extracellular solute-binding protein family 1  24.54 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.95 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  20.65 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  24.02 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  24.18 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1289  extracellular solute-binding protein  23.42 
 
 		 479 aa  61.2  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 458 aa  61.6  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>