248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_14550 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
432 aa  885    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  58.49 
 
 
424 aa  534  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  47.44 
 
 
485 aa  370  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  44.23 
 
 
450 aa  342  5e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  44.23 
 
 
450 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  42.31 
 
 
450 aa  334  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  44.17 
 
 
544 aa  333  5e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  41.69 
 
 
449 aa  326  5e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  41.9 
 
 
451 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  42.57 
 
 
452 aa  319  5e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  41.87 
 
 
452 aa  318  9e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  39.09 
 
 
452 aa  307  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  40.35 
 
 
453 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  41.81 
 
 
440 aa  306  6e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 
449 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  40.1 
 
 
453 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  40.4 
 
 
452 aa  296  4e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  36.92 
 
 
448 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  37.14 
 
 
457 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  36.72 
 
 
447 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  36.95 
 
 
448 aa  263  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  35.9 
 
 
451 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  34.78 
 
 
498 aa  243  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  37.44 
 
 
464 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.52 
 
 
448 aa  239  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  35.25 
 
 
482 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  35.22 
 
 
455 aa  226  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  34.55 
 
 
457 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  35.7 
 
 
462 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  35.71 
 
 
444 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  33.84 
 
 
448 aa  213  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  32.51 
 
 
447 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 
464 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  32.08 
 
 
466 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  31.81 
 
 
447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  31.89 
 
 
436 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  31.14 
 
 
404 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  30.56 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  26.48 
 
 
417 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 
423 aa  84.7  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 
495 aa  84  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 
435 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 
422 aa  79.7  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 
433 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.61 
 
 
423 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.63 
 
 
408 aa  77  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 
435 aa  73.9  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 
473 aa  73.2  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.07 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  26.83 
 
 
447 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 
432 aa  70.1  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 
434 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 
438 aa  68.2  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  24.06 
 
 
428 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
452 aa  66.6  0.0000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 
444 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  23.59 
 
 
477 aa  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
434 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 
445 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 
427 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  27.31 
 
 
461 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3329  extracellular solute-binding protein  30.81 
 
 
428 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.955635  normal  0.757839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 
442 aa  64.7  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  22.19 
 
 
455 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 
443 aa  64.3  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  26.43 
 
 
461 aa  63.5  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 
435 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 
493 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 
429 aa  61.6  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.28 
 
 
407 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
460 aa  62  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 
445 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 
468 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 
445 aa  61.2  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  20.44 
 
 
434 aa  60.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 
432 aa  60.1  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  20.81 
 
 
442 aa  59.3  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 
408 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 
442 aa  59.3  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2047  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.01 
 
 
479 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5548  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2283  extracellular solute-binding protein  21.72 
 
 
456 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  hitchhiker  0.0000190717 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  22.31 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 
428 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0174  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 
951 aa  58.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.01491  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 
421 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 
446 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  28.96 
 
 
425 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 
422 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4015  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 
428 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.946152  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.32 
 
 
438 aa  57  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  25.57 
 
 
414 aa  56.6  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
462 aa  57  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.07 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4344  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0302279  hitchhiker  0.00000351134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>