More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0621 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 427 aa  863    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  28.92 
 
 		 422 aa  180  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  30.61 
 
 		 417 aa  159  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  28.09 
 
 		 419 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1651  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.660801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.09 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.09 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 419 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1356  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 418 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0142784  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 429 aa  141  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 419 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 458 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.29 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 424 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 424 aa  123  5e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  26.33 
 
 		 424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  22.77 
 
 		 444 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.65 
 
 		 422 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 455 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  27.59 
 
 		 429 aa  111  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 470 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.29 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.02 
 
 		 438 aa  106  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 		 454 aa  106  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  25.82 
 
 		 466 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  23.23 
 
 		 419 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 		 495 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.34 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 435 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  23.38 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 451 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.59 
 
 		 434 aa  104  4e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 435 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  24.09 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  23.68 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  22.04 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.81 
 
 		 441 aa  100  6e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 415 aa  99  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  27.37 
 
 		 432 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 403 aa  96.3  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 431 aa  95.9  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.89 
 
 		 429 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.79 
 
 		 428 aa  95.1  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  26.77 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 444 aa  94.4  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 415 aa  94  4e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 441 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  22.97 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  24.38 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  28.71 
 
 		 425 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  24.83 
 
 		 433 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  30.42 
 
 		 423 aa  88.2  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 444 aa  88.6  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 		 451 aa  88.2  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  26.58 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 		 427 aa  87  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  26.4 
 
 		 425 aa  87  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  29.05 
 
 		 422 aa  87  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  28.18 
 
 		 428 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 443 aa  86.7  7e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.72 
 
 		 431 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  24.91 
 
 		 414 aa  86.7  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 408 aa  86.3  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  28.75 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  20.74 
 
 		 429 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  21.99 
 
 		 414 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 468 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  24.05 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  28.75 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  22.5 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  30.62 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  26.9 
 
 		 423 aa  84.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 417 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.86 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.91 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  22.66 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  25.99 
 
 		 442 aa  80.9  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  25.06 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1947  extracellular solute-binding protein  22.59 
 
 		 428 aa  79.7  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.709657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>