More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2590 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 464 aa  917    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  57.14 
 
 		 451 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  46.96 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  36.34 
 
 		 470 aa  289  7e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  34.62 
 
 		 444 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  34.78 
 
 		 445 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  30.31 
 
 		 466 aa  171  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.85 
 
 		 442 aa  156  6e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.41 
 
 		 441 aa  150  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1360  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.937812  normal  0.278157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3365  extracellular solute-binding protein family 1  28.87 
 
 		 455 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.079846  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29 
 
 		 435 aa  119  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4612  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.18 
 
 		 444 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 450 aa  110  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  25.16 
 
 		 431 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 435 aa  103  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 431 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  28.63 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  27.64 
 
 		 434 aa  90.5  6e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 422 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.54 
 
 		 429 aa  85.5  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  23 
 
 		 420 aa  79.7  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.67 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 446 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  25.43 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.44 
 
 		 428 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  21.71 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  26.29 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 451 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  23.88 
 
 		 437 aa  73.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  23.99 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  31.44 
 
 		 427 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.16 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.33 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  22.36 
 
 		 454 aa  70.1  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  20.56 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.21 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  23.47 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  24.04 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  22.16 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  26.83 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23850  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.05 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 449 aa  65.9  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  23.24 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  23.33 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.92 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4563  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  23.01 
 
 		 448 aa  63.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.62 
 
 		 426 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  22.27 
 
 		 495 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.47 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.25 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  20.7 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  27.9 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3595  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.931004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  23.62 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.85 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>