146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1360 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1360  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 478 aa  985    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.937812  normal  0.278157 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3365  extracellular solute-binding protein family 1  53.98 
 
 		 455 aa  498  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.079846  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  33.85 
 
 		 441 aa  207  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.2 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  30.18 
 
 		 452 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  30.17 
 
 		 466 aa  143  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  29.5 
 
 		 464 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 470 aa  119  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.94 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4612  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 437 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  28.09 
 
 		 431 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 431 aa  86.7  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 452 aa  77.4  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.46 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  24.25 
 
 		 461 aa  66.6  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  24.5 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  26.32 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.98 
 
 		 400 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  23.44 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.13 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0227  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.998322  normal  0.257108 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 434 aa  57  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.48 
 
 		 455 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  21.96 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3207  extracellular solute-binding protein  30.82 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 408 aa  55.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 		 467 aa  53.9  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0891  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 438 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0493428 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 412 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 		 463 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.84 
 
 		 406 aa  53.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 412 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  25.62 
 
 		 439 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 443 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  27.37 
 
 		 434 aa  50.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  21.24 
 
 		 493 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  20.06 
 
 		 417 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1885  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 419 aa  50.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  23.08 
 
 		 435 aa  50.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 416 aa  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  24.44 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 444 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  24.27 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 420 aa  50.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 430 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4033  extracellular solute-binding protein  24.67 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 439 aa  49.3  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  25.78 
 
 		 374 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1699  extracellular solute-binding protein family 1  30.15 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  27.06 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  21.86 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0145  extracellular solute-binding protein family 1  23.22 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  25.65 
 
 		 427 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 478 aa  47.4  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  23.26 
 
 		 441 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 426 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4278  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 442 aa  47  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 419 aa  46.6  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  21.5 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  24.81 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  25.59 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0228  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6533  normal  0.282981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0238  maltose ABC transporter periplasmic protein  26.54 
 
 		 396 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.941451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  22.73 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6765  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4871  extracellular solute-binding protein family 1  24.09 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.618682  normal  0.377624 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  21.83 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>