210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1257 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
467 aa  954    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  64.75 
 
 
477 aa  595  1e-169  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  63.3 
 
 
473 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1029  sugar-binding periplasmic protein  36.12 
 
 
491 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0247417 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0654  extracellular solute-binding protein family 1  34.25 
 
 
554 aa  253  6e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  35.52 
 
 
415 aa  216  8e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  34.42 
 
 
412 aa  205  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 
412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 
454 aa  190  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0808  arabinose ABC transporter, arabinose binding protein  30.84 
 
 
620 aa  176  8e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 
455 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  31.74 
 
 
423 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  34.1 
 
 
432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 
435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  32.09 
 
 
431 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  31.27 
 
 
434 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 
415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  31.31 
 
 
428 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  31.37 
 
 
416 aa  159  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 
414 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  28.92 
 
 
425 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 
432 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  29.18 
 
 
414 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 
419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
415 aa  134  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 
430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 
413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 
419 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  30.81 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  29.38 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4278  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 
442 aa  105  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  27.4 
 
 
428 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  27.73 
 
 
417 aa  97.1  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
431 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 
425 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  26.89 
 
 
421 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  29.17 
 
 
420 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 
417 aa  94  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  27.3 
 
 
421 aa  93.6  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
428 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.53 
 
 
428 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.5 
 
 
415 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  28.82 
 
 
420 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 
420 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0862  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
397 aa  91.3  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  27.64 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 
414 aa  90.9  5e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 
417 aa  90.5  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 
415 aa  90.5  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 
415 aa  90.1  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 
395 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.577743 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  27.4 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
428 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  28.76 
 
 
415 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 
433 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 
429 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1813  extracellular solute-binding protein family 1  25.29 
 
 
411 aa  87  7e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.5 
 
 
415 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  25.25 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
418 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 
415 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  28.31 
 
 
415 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  29.06 
 
 
415 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
425 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  25.74 
 
 
425 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  27.94 
 
 
374 aa  83.6  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  27.67 
 
 
416 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
415 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
415 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  27.02 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  27.02 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  24.47 
 
 
414 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1090  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 
417 aa  79.7  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.02 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.02 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.02 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.02 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.02 
 
 
415 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  27.69 
 
 
415 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
416 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
412 aa  79  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 
418 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1824  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 
449 aa  78.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  27.14 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 
415 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4502  extracellular solute-binding protein family 1  21.86 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  21.81 
 
 
410 aa  73.6  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2520  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4321  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
418 aa  70.5  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29280  sugar ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  24.86 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 
436 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 
411 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 
411 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>