More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_20520 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
417 aa  860    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  52.66 
 
 
408 aa  448  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  47.9 
 
 
408 aa  396  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  46.45 
 
 
422 aa  388  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  45.95 
 
 
408 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  43.03 
 
 
410 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  41.69 
 
 
420 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  41.69 
 
 
420 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  42.05 
 
 
419 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  41.54 
 
 
419 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  41.54 
 
 
419 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  40.96 
 
 
414 aa  318  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  39.27 
 
 
417 aa  315  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  40.77 
 
 
419 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  40.26 
 
 
421 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  38.52 
 
 
417 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  37.68 
 
 
413 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  37.56 
 
 
399 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  37.89 
 
 
380 aa  297  3e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  36.5 
 
 
441 aa  286  5e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  37.67 
 
 
412 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  37.4 
 
 
412 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 
412 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  38.36 
 
 
412 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  38.87 
 
 
420 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  36.55 
 
 
432 aa  269  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  32.43 
 
 
414 aa  260  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 
424 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  32.77 
 
 
424 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  32.91 
 
 
446 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  35.41 
 
 
445 aa  216  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  33.42 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  33.42 
 
 
445 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  30.89 
 
 
427 aa  213  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  31.57 
 
 
438 aa  211  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
631 aa  156  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  30.89 
 
 
431 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  30.51 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  29.63 
 
 
441 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  27.25 
 
 
420 aa  140  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  32.42 
 
 
495 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 
415 aa  131  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
452 aa  130  6e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.58 
 
 
427 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 
414 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 
418 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  24.73 
 
 
434 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 
435 aa  124  3e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
422 aa  124  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  29.84 
 
 
429 aa  123  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 
424 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 
423 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 
441 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 
424 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 
441 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 
419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 
455 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 
455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 
468 aa  114  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.35 
 
 
435 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 
422 aa  114  3e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 
428 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 
454 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  26.18 
 
 
414 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 
432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 
424 aa  110  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 
435 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 
429 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.94 
 
 
426 aa  107  5e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 
439 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  25.14 
 
 
437 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 
446 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 
434 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 
433 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  24.1 
 
 
470 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 
416 aa  104  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 
435 aa  103  6e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.59 
 
 
436 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
444 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 
440 aa  100  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 
423 aa  100  6e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 
441 aa  99.8  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.43 
 
 
434 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 
434 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 
466 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  23.71 
 
 
415 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 
451 aa  98.2  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.68 
 
 
419 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  27.72 
 
 
419 aa  98.2  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.09 
 
 
438 aa  97.4  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 
432 aa  97.4  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  23.98 
 
 
419 aa  97.1  5e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  24 
 
 
412 aa  97.1  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 
435 aa  96.7  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.77 
 
 
419 aa  96.7  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>