More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3600 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 425 aa  875    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  72.64 
 
 		 424 aa  625  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  41.45 
 
 		 429 aa  331  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.65 
 
 		 458 aa  231  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.66 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.63 
 
 		 413 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.63 
 
 		 399 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 444 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 417 aa  93.6  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.83 
 
 		 410 aa  90.1  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 439 aa  87.8  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  28.45 
 
 		 431 aa  86.7  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 422 aa  82.8  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.96 
 
 		 419 aa  79.7  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  23.96 
 
 		 419 aa  79.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  27.55 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  27.21 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  24.91 
 
 		 412 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  24.38 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 421 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6532  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0178193 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0208  putative extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 458 aa  73.6  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0085185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.72 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 445 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  22.75 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  24.52 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  26.21 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.19 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  22.28 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  25.73 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2472  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  25.91 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.78 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5608  extracellular solute-binding protein family 1  26.78 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.959607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  23.4 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3153  extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000182033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  26.49 
 
 		 455 aa  67  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  23.83 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  29.38 
 
 		 421 aa  66.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.3 
 
 		 424 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 495 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  22.86 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2209  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 487 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 418 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  27.27 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0115  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132691  normal  0.193469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  25.93 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  27.82 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0552  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.764632 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03340  extracellular solute-binding protein family 1  28.67 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 463 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  26.82 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  31.21 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4609  extracellular solute-binding protein family 1  27.95 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2283  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  hitchhiker  0.0000190717 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  27.87 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.11 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>