241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4349 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 415 aa  852    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  61.33 
 
 		 420 aa  519  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  60.39 
 
 		 417 aa  520  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  57.93 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  62.33 
 
 		 420 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  61.8 
 
 		 420 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  56.08 
 
 		 429 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  54.37 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  57.25 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  57.18 
 
 		 417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  55.9 
 
 		 425 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  54.71 
 
 		 418 aa  438  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  52.59 
 
 		 428 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  52.09 
 
 		 413 aa  434  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  54.57 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  52.04 
 
 		 433 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  54.81 
 
 		 415 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  52.14 
 
 		 415 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  52.91 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  54.08 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  52.14 
 
 		 415 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  53.57 
 
 		 428 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  50.61 
 
 		 415 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  53.08 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  52.38 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  53.08 
 
 		 415 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  53.35 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  53.35 
 
 		 415 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  53.08 
 
 		 415 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  51.28 
 
 		 415 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  53.08 
 
 		 415 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  53.09 
 
 		 428 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  47.61 
 
 		 421 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  48.33 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  53.48 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  53.48 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  53.48 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  53.48 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  53.48 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  53.48 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  53.48 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  53.48 
 
 		 415 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  49.76 
 
 		 415 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  49.49 
 
 		 414 aa  388  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  45.78 
 
 		 420 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  47.5 
 
 		 414 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  43.54 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  45.32 
 
 		 420 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  44.93 
 
 		 420 aa  359  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  45.84 
 
 		 419 aa  358  8e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  45.84 
 
 		 419 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1090  extracellular solute-binding protein  41.2 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  43.07 
 
 		 402 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  42.03 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  42.03 
 
 		 425 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29280  sugar ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  36.53 
 
 		 388 aa  283  3.0000000000000004e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  37.56 
 
 		 411 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  37.47 
 
 		 412 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  37.23 
 
 		 412 aa  259  6e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  35.03 
 
 		 414 aa  258  2e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  38.6 
 
 		 412 aa  257  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4278  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 		 442 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2399  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  36.93 
 
 		 411 aa  250  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  36.67 
 
 		 414 aa  249  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  35.02 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  34.92 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4321  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 409 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  34.95 
 
 		 411 aa  234  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  34.24 
 
 		 410 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  35.11 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  33.67 
 
 		 411 aa  223  7e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  33.16 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  33.77 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  33.88 
 
 		 435 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  33.16 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  33.69 
 
 		 455 aa  179  9e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  32.6 
 
 		 434 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  32.34 
 
 		 431 aa  176  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2283  extracellular solute-binding protein  27.69 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  hitchhiker  0.0000190717 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  29.76 
 
 		 415 aa  168  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  32.75 
 
 		 428 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 430 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 		 412 aa  156  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  29.69 
 
 		 416 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 414 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  29.26 
 
 		 425 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  28.72 
 
 		 412 aa  137  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  29.21 
 
 		 423 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2520  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1813  extracellular solute-binding protein family 1  25.49 
 
 		 411 aa  99.8  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  27.01 
 
 		 477 aa  96.3  9e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 473 aa  94.4  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 467 aa  90.1  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1029  sugar-binding periplasmic protein  28.23 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0247417 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0862  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>