More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2327 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  97.17 
 
 		 424 aa  837    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 424 aa  880    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  44.29 
 
 		 408 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  41.84 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  42.66 
 
 		 408 aa  324  1e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  43.1 
 
 		 413 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  43.1 
 
 		 399 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  38.17 
 
 		 417 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  37.23 
 
 		 414 aa  276  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  40.73 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  40.73 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  40.73 
 
 		 419 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  40.45 
 
 		 419 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  38.3 
 
 		 421 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  40.45 
 
 		 419 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 		 419 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  37.53 
 
 		 408 aa  270  4e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 		 417 aa  265  8e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  36.84 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 412 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 412 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  34.14 
 
 		 417 aa  246  6e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 412 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  35.96 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  37.16 
 
 		 420 aa  239  8e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.78 
 
 		 380 aa  232  9e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  32.86 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  31.31 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  30.85 
 
 		 438 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  29.71 
 
 		 414 aa  189  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  31.09 
 
 		 445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  32.14 
 
 		 445 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  30.16 
 
 		 445 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  28.01 
 
 		 427 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  32.33 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3985  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 631 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0580929  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  29.56 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  30.45 
 
 		 434 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  28.83 
 
 		 427 aa  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  23.86 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 		 435 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 432 aa  96.7  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.01 
 
 		 427 aa  95.9  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 423 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  26.9 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 435 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 451 aa  91.3  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  29.15 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3405  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 419 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 455 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 495 aa  87.8  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 442 aa  87.8  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  27.05 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  31.62 
 
 		 428 aa  87.8  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2706  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 422 aa  87  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.5087  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 441 aa  87  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  27.42 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.61 
 
 		 424 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  26.11 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  29.11 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  28.12 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.14 
 
 		 458 aa  82.8  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  27.18 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 416 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.21 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  22.81 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 		 415 aa  77  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  25.91 
 
 		 420 aa  76.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 425 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 436 aa  76.3  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  22.99 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.25 
 
 		 427 aa  75.9  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 444 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 419 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  22.4 
 
 		 418 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  22 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  25.54 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  25.88 
 
 		 424 aa  73.2  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.31 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.27 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  21.45 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.85 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>