More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1133 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 451 aa  928    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  52.81 
 
 		 420 aa  443  1e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  49.21 
 
 		 444 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  47.93 
 
 		 435 aa  419  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  47.14 
 
 		 422 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  43.15 
 
 		 431 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 		 441 aa  217  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  33.5 
 
 		 495 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  33.59 
 
 		 434 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  33.42 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  34.6 
 
 		 442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  32.82 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.01 
 
 		 438 aa  196  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.08 
 
 		 435 aa  194  4e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  32.01 
 
 		 441 aa  192  8e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  32.58 
 
 		 442 aa  192  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  33.42 
 
 		 427 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  28.81 
 
 		 424 aa  182  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 441 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 424 aa  166  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  29.46 
 
 		 429 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.31 
 
 		 428 aa  149  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  30.66 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  27.94 
 
 		 433 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.09 
 
 		 427 aa  144  4e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 439 aa  142  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  27.89 
 
 		 427 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  32.06 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  30.12 
 
 		 443 aa  138  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.72 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  28.19 
 
 		 419 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 434 aa  133  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  27.42 
 
 		 434 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 		 431 aa  130  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.29 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  25.86 
 
 		 424 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  28.66 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.48 
 
 		 426 aa  110  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 451 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  24.55 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  28.94 
 
 		 432 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 408 aa  101  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  25.2 
 
 		 437 aa  99.8  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.94 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 457 aa  97.1  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.73 
 
 		 410 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.11 
 
 		 408 aa  94  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 436 aa  94  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 417 aa  92.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  24.68 
 
 		 449 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  29.12 
 
 		 452 aa  89.7  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  23.97 
 
 		 444 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  26.73 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.91 
 
 		 441 aa  89.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  24.66 
 
 		 439 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0374  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0240532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 461 aa  89  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 425 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.25 
 
 		 413 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.4 
 
 		 380 aa  88.2  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  24.72 
 
 		 435 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 455 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  30.13 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 423 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 493 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  22.64 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  24.14 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4267  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  31.1 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 443 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  26.48 
 
 		 412 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 420 aa  73.9  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4289  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.53848  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 		 412 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  23.89 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1120  putative maltosaccharide ABC transporter, maltosaccharide-binding protein  25.25 
 
 		 419 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000383609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4136  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.17 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>