More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3054 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 429 aa  860    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  72.26 
 
 		 427 aa  630  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  57.28 
 
 		 427 aa  478  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  56.12 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  54.2 
 
 		 432 aa  422  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  47.2 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  46.06 
 
 		 433 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  46.65 
 
 		 431 aa  369  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  47.32 
 
 		 428 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  45.57 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  41.03 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  40.9 
 
 		 443 aa  288  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  37.35 
 
 		 436 aa  286  7e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  38.56 
 
 		 495 aa  264  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  34.66 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  31.88 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  30.73 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  32.97 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  31.3 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  30.61 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  31.65 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 435 aa  159  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  29.3 
 
 		 451 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  31.17 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  27.38 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  30.77 
 
 		 434 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  33.92 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  32.35 
 
 		 442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.02 
 
 		 438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 431 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.71 
 
 		 435 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  32.31 
 
 		 441 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  30.46 
 
 		 435 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  30.7 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  24.82 
 
 		 441 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  31.08 
 
 		 428 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  26.5 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 		 444 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.29 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 		 412 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  29.45 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  29.26 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.94 
 
 		 406 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  26.02 
 
 		 437 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  28.16 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.6 
 
 		 399 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.6 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 439 aa  103  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  27.08 
 
 		 451 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  28.48 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.03 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  27.51 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.93 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.08 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 419 aa  98.2  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.36 
 
 		 441 aa  96.7  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  26.86 
 
 		 424 aa  94.4  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 		 445 aa  94  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  26.22 
 
 		 454 aa  93.2  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  34.01 
 
 		 447 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  24.44 
 
 		 468 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  27.52 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 432 aa  90.9  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 445 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 408 aa  87.8  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  28.53 
 
 		 422 aa  86.3  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  28.32 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.29 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  27.98 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  26.18 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  31.34 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0913  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.92 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  26.38 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  27.8 
 
 		 422 aa  82  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>