More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0972 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 442 aa  898    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  64.46 
 
 		 442 aa  563  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  62.58 
 
 		 448 aa  554  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  65.13 
 
 		 441 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  59.05 
 
 		 441 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  47.1 
 
 		 435 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  43.74 
 
 		 438 aa  358  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  40.14 
 
 		 428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  38.41 
 
 		 434 aa  315  7e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  34.71 
 
 		 424 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  35.92 
 
 		 420 aa  235  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  35.5 
 
 		 422 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  34.33 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  34.6 
 
 		 451 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  32.43 
 
 		 444 aa  186  6e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  33.42 
 
 		 427 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 431 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  30.45 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  29.67 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  32.52 
 
 		 441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  31.34 
 
 		 427 aa  128  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  28.94 
 
 		 419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 424 aa  127  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  31.46 
 
 		 434 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 435 aa  127  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  31.87 
 
 		 432 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  30.7 
 
 		 429 aa  123  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 439 aa  122  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  32.2 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.95 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  32.01 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  33.03 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  27.93 
 
 		 424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 435 aa  111  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  29.92 
 
 		 413 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 421 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  29.92 
 
 		 399 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.68 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  30.21 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  26.79 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 419 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.9 
 
 		 410 aa  103  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 419 aa  100  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  29.59 
 
 		 443 aa  97.8  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  24.82 
 
 		 408 aa  97.1  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  27.6 
 
 		 493 aa  96.7  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 434 aa  93.6  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 468 aa  93.2  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 		 424 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 440 aa  89  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 414 aa  88.6  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 414 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.91 
 
 		 417 aa  87.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.19 
 
 		 380 aa  86.7  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  26.41 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.66 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3983  extracellular solute-binding protein family 1  27.48 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  23.77 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  23.87 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.77 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 466 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  23.13 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 		 444 aa  78.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 443 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  32.34 
 
 		 424 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  26.72 
 
 		 420 aa  77.4  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2327  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.169538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  28.92 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 		 423 aa  77  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  32.13 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.91 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  26.84 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 462 aa  75.1  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  24.21 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  26.1 
 
 		 451 aa  74.3  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>