244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3914 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 457 aa  926    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  62.58 
 
 		 464 aa  569  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  60.87 
 
 		 462 aa  556  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  57.8 
 
 		 448 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  56.02 
 
 		 451 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  56.05 
 
 		 447 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  56.86 
 
 		 464 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  57.97 
 
 		 457 aa  508  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  55.99 
 
 		 448 aa  482  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  50.77 
 
 		 448 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  52.55 
 
 		 498 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  50.12 
 
 		 482 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  41.87 
 
 		 485 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  39.34 
 
 		 453 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  39.57 
 
 		 453 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 		 451 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  38.12 
 
 		 450 aa  277  3e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  39.63 
 
 		 449 aa  270  4e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  36.7 
 
 		 449 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  37.29 
 
 		 544 aa  269  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  36.88 
 
 		 452 aa  269  8.999999999999999e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  37.07 
 
 		 452 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  37.9 
 
 		 450 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  37.9 
 
 		 450 aa  267  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  36.13 
 
 		 452 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  37.14 
 
 		 432 aa  263  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  33.69 
 
 		 452 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  35.47 
 
 		 424 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.04 
 
 		 448 aa  228  1e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  33.26 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  31.45 
 
 		 455 aa  173  6.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  31.69 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 466 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 436 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  31.01 
 
 		 442 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  29.71 
 
 		 447 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 404 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  26.36 
 
 		 447 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  27.12 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  25.88 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  29.73 
 
 		 431 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  34.45 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 417 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 442 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.16 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  26.47 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.29 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0556  ABC transporter, solute-binding protein  23.92 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  20.79 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  27.02 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.46 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.54 
 
 		 427 aa  69.7  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 462 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0540  ABC transporter, substrate-binding protein  22.14 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  26.53 
 
 		 423 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 422 aa  65.9  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 428 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3623  extracellular solute-binding protein family 1  28.41 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00170169  normal  0.0768086 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  22.41 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  26.88 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 430 aa  63.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 495 aa  63.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.54 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  24.64 
 
 		 428 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  25.6 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 441 aa  60.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.82 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  26.67 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1342  5'-Nucleotidase domain protein  49.09 
 
 		 618 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.206839  normal  0.550173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  27.33 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  24.64 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  31.01 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  28.97 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 		 493 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  25.81 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2102  periplasmic protein  26.14 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.502645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>