74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2855 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  67.42 
 
 		 450 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  67.77 
 
 		 453 aa  648    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  68.21 
 
 		 453 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  68.36 
 
 		 452 aa  642    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  67.65 
 
 		 450 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 451 aa  920    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  66.67 
 
 		 452 aa  644    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  63.5 
 
 		 452 aa  628  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  64.75 
 
 		 450 aa  630  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  63.64 
 
 		 449 aa  612  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  64.3 
 
 		 544 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  62.79 
 
 		 452 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  59.43 
 
 		 449 aa  523  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  41.23 
 
 		 485 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  41.9 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  39.8 
 
 		 424 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  39.76 
 
 		 457 aa  288  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  40.33 
 
 		 464 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  39.36 
 
 		 462 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  36.97 
 
 		 448 aa  274  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  35.84 
 
 		 451 aa  272  8.000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  39.26 
 
 		 447 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  34.96 
 
 		 448 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  40.46 
 
 		 440 aa  263  6.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  36.23 
 
 		 498 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  36.89 
 
 		 464 aa  256  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  38.28 
 
 		 457 aa  253  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  35.58 
 
 		 448 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  34.84 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  35.61 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  35.68 
 
 		 455 aa  209  9e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  33.84 
 
 		 444 aa  202  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  32.94 
 
 		 466 aa  196  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  32.23 
 
 		 436 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  32.04 
 
 		 442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  29.97 
 
 		 447 aa  169  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  30.08 
 
 		 404 aa  162  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 447 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 441 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  21.79 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  22.34 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  21.8 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  22.84 
 
 		 441 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4984  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  21.81 
 
 		 495 aa  52.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  24.69 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.6 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  21.63 
 
 		 452 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0849  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0177782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  22.32 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 434 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  25.31 
 
 		 445 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  23.67 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 408 aa  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  28.36 
 
 		 451 aa  47.8  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  24.73 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  22.52 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 443 aa  47  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 		 421 aa  46.6  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  22.09 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  22.91 
 
 		 423 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  23.32 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  26.43 
 
 		 493 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.76 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1371  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  24.87 
 
 		 428 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  22.57 
 
 		 448 aa  43.9  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  24.33 
 
 		 473 aa  43.1  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>