233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2626 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 455 aa  898    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  48.4 
 
 		 444 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  48.37 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  45.56 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  45.61 
 
 		 442 aa  356  5e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  45.39 
 
 		 447 aa  337  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  37.66 
 
 		 485 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  34.99 
 
 		 432 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  35.68 
 
 		 451 aa  209  8e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  32.88 
 
 		 424 aa  207  4e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  34.23 
 
 		 450 aa  206  8e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  33.11 
 
 		 440 aa  205  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  33.87 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  31.9 
 
 		 452 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  33.26 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  33.03 
 
 		 450 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  33.82 
 
 		 449 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 452 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  33.77 
 
 		 464 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  33.5 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  31.88 
 
 		 482 aa  183  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  30.8 
 
 		 451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  30.95 
 
 		 453 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  30.95 
 
 		 453 aa  179  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  32.32 
 
 		 448 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.45 
 
 		 448 aa  179  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 462 aa  178  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  32.91 
 
 		 452 aa  178  2e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  31.35 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  31.05 
 
 		 447 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  33.08 
 
 		 498 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  31.27 
 
 		 457 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  31.54 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  33.19 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  27.19 
 
 		 448 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  26.83 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 433 aa  98.2  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.75 
 
 		 408 aa  88.2  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  22.67 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  23.12 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  30.23 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  23.54 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.95 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  24.53 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  21.64 
 
 		 495 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 427 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  27.55 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 445 aa  68.9  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  25.23 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  23.36 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  23.55 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  28.48 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  22.83 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 428 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  24.45 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  24.52 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0940  extracellular solute-binding protein family 1  28.18 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.558741 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.94 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.64 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  22.64 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  20.86 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1705  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.751939  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  27.19 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 446 aa  59.7  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 448 aa  59.3  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  26.89 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  29.78 
 
 		 417 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2806  extracellular solute-binding protein family 1  26.7 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.636428  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  21.96 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 441 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  22.93 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0637  extracellular solute-binding protein  26.09 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.07 
 
 		 422 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  27.15 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 419 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  32.22 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>