85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0402 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 447 aa  905    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  43.06 
 
 		 404 aa  303  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  34.26 
 
 		 424 aa  233  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  31.82 
 
 		 432 aa  213  7e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 453 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  30.05 
 
 		 453 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  28.68 
 
 		 452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  30.7 
 
 		 444 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 544 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  29.9 
 
 		 450 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 		 449 aa  166  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 450 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  29.42 
 
 		 440 aa  162  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  31.69 
 
 		 466 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  29.04 
 
 		 451 aa  160  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  27.59 
 
 		 452 aa  161  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 		 449 aa  159  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  26.26 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 		 485 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  26.47 
 
 		 452 aa  149  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  27.63 
 
 		 442 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 455 aa  129  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  24.49 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.73 
 
 		 448 aa  124  5e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  28.2 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 482 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  26.34 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 448 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  27.4 
 
 		 447 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  25.45 
 
 		 448 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  27.18 
 
 		 447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 498 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 464 aa  109  9.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  24.08 
 
 		 457 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  24.69 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 431 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  24.56 
 
 		 423 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  21.06 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  21.5 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  21.51 
 
 		 415 aa  59.7  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  26.17 
 
 		 412 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  21.21 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  22.17 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  23.47 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.48 
 
 		 426 aa  56.6  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1090  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  23.56 
 
 		 414 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  22.61 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  23.58 
 
 		 445 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  18.04 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  22.78 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  23.21 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  20.05 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.42 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  24 
 
 		 455 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  23.22 
 
 		 415 aa  50.1  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  20.44 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  20.44 
 
 		 412 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  21.5 
 
 		 452 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0862  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  21.56 
 
 		 419 aa  48.5  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 432 aa  47.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  21.24 
 
 		 454 aa  47.4  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  20.9 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 443 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  21.83 
 
 		 435 aa  46.2  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7516  extracellular solute-binding protein family 1  20.98 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  20.77 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  20.37 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  20.37 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  21.2 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  21.13 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>