261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1625 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  100 
 
 		 442 aa  889    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  78.77 
 
 		 436 aa  682    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  46.62 
 
 		 444 aa  395  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  48.13 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  45.61 
 
 		 455 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  44.22 
 
 		 447 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  34.7 
 
 		 424 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  32.55 
 
 		 485 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  33.18 
 
 		 451 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  31.97 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  30.7 
 
 		 432 aa  186  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 		 452 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 		 449 aa  183  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  31.21 
 
 		 440 aa  182  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 		 450 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  30.62 
 
 		 448 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 544 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  31.91 
 
 		 452 aa  176  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  32.16 
 
 		 453 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  30.91 
 
 		 450 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  32.16 
 
 		 453 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 450 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  31.57 
 
 		 462 aa  168  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  30.87 
 
 		 452 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  29.86 
 
 		 464 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.44 
 
 		 448 aa  160  5e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  29.02 
 
 		 449 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 		 457 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  27.85 
 
 		 452 aa  152  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  27.92 
 
 		 448 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  28.5 
 
 		 448 aa  149  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  28.57 
 
 		 464 aa  144  4e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  29.06 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  29 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 404 aa  122  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5137  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 433 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.319423  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5673  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 435 aa  104  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0285739  normal  0.0925972 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  26.3 
 
 		 431 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 435 aa  97.4  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 455 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 417 aa  93.6  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 408 aa  90.5  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 421 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 423 aa  82.8  0.00000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.78 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  23.31 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  26.81 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 417 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  22.68 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2914  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  24.29 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7922  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  24.41 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  21.57 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  25.35 
 
 		 422 aa  72  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  26.01 
 
 		 442 aa  72  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  29.12 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 419 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  22.05 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  23.51 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  23.26 
 
 		 427 aa  67.4  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  25.79 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  29.73 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0998  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 451 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 442 aa  65.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  26.18 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  23.91 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.6 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.51 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  24.39 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  22.57 
 
 		 439 aa  63.2  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.18 
 
 		 435 aa  63.2  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2308  extracellular solute-binding protein  21.03 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000253431  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.78 
 
 		 438 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  24.46 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  21.8 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 411 aa  60.1  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1941  extracellular solute-binding protein family 1  23.49 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.948884  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  21.88 
 
 		 477 aa  60.1  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>