More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0882 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
419 aa  852    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  42.65 
 
 
428 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  41.71 
 
 
432 aa  324  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 
435 aa  288  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  37.75 
 
 
455 aa  285  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  39.14 
 
 
425 aa  282  7.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  38.78 
 
 
454 aa  281  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  39.35 
 
 
415 aa  275  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  39.43 
 
 
414 aa  272  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  39.38 
 
 
416 aa  271  2e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  38.8 
 
 
412 aa  267  2e-70  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  41.11 
 
 
414 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  35.99 
 
 
434 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  34.74 
 
 
423 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  36.25 
 
 
431 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 
412 aa  247  3e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  34.09 
 
 
415 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  31.83 
 
 
432 aa  225  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
415 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  30.92 
 
 
430 aa  188  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1813  extracellular solute-binding protein family 1  30.4 
 
 
411 aa  167  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  31.58 
 
 
417 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  28.29 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 
467 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0862  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 
397 aa  139  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.94 
 
 
395 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.577743 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4502  extracellular solute-binding protein family 1  28.2 
 
 
427 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 
431 aa  136  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 
473 aa  136  9e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  29.5 
 
 
420 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  31.25 
 
 
428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 
417 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
477 aa  134  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  29.72 
 
 
417 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  28.86 
 
 
419 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 
420 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 
421 aa  133  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 
420 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1824  extracellular solute-binding protein family 1  28.7 
 
 
449 aa  132  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2520  extracellular solute-binding protein family 1  27.81 
 
 
452 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  29.4 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  28.82 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  29.75 
 
 
416 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  28.35 
 
 
419 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  29.04 
 
 
410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  29.23 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
418 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  24.87 
 
 
414 aa  123  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  31.92 
 
 
433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.82 
 
 
421 aa  121  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  31.53 
 
 
428 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  27.3 
 
 
420 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  27.03 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  26.82 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 
428 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4321  extracellular solute-binding protein  26.15 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
414 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 
411 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 
411 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  31.73 
 
 
428 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 
428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1090  extracellular solute-binding protein  24.31 
 
 
417 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  25.14 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 
412 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2399  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.25 
 
 
411 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 
412 aa  106  7e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
425 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 
425 aa  106  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 
402 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 
415 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
411 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 
411 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  28 
 
 
410 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 
414 aa  99  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  27.71 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  25.34 
 
 
374 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  27.37 
 
 
415 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 
415 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29280  sugar ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  23.18 
 
 
388 aa  92.4  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  27.13 
 
 
415 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  32.68 
 
 
428 aa  91.3  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.62 
 
 
415 aa  91.3  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  27.42 
 
 
415 aa  90.9  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
415 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
415 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
415 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  27.62 
 
 
415 aa  89.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  24.15 
 
 
410 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4278  extracellular solute-binding protein  22.89 
 
 
442 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  27.62 
 
 
415 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  27.62 
 
 
415 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.62 
 
 
415 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.62 
 
 
415 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.62 
 
 
415 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.62 
 
 
415 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.62 
 
 
415 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 
415 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>