159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001061 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  100 
 
 		 414 aa  851    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 420 aa  286  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  36.48 
 
 		 416 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  36.41 
 
 		 417 aa  282  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  36.3 
 
 		 417 aa  276  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  37.6 
 
 		 425 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 		 416 aa  272  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  37.53 
 
 		 418 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  34.69 
 
 		 428 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  36.34 
 
 		 413 aa  264  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  35.28 
 
 		 415 aa  263  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  35.8 
 
 		 431 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  39.18 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  36.93 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  38.2 
 
 		 420 aa  259  9e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  38.2 
 
 		 420 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 421 aa  252  8.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  34.35 
 
 		 421 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  37.27 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  35.27 
 
 		 433 aa  249  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  35.83 
 
 		 410 aa  249  9e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  31.75 
 
 		 420 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  31.23 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  36.21 
 
 		 428 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  36.18 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  36.34 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  35.22 
 
 		 428 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  33.76 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  31.04 
 
 		 419 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  31.17 
 
 		 420 aa  237  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  35.36 
 
 		 415 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  34.3 
 
 		 415 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  34.04 
 
 		 415 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29280  sugar ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  31.42 
 
 		 388 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  34.41 
 
 		 415 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  33.87 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  33.87 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  33.87 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  33.87 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  33.87 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  33.87 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  33.87 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  33.87 
 
 		 415 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  31.28 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1090  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 417 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  33.06 
 
 		 415 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  32.8 
 
 		 415 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4278  extracellular solute-binding protein  31.11 
 
 		 442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  31.89 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 425 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  32.89 
 
 		 425 aa  193  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.88 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4321  extracellular solute-binding protein  33.23 
 
 		 409 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  32.5 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  30.72 
 
 		 412 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  30.29 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  29.86 
 
 		 412 aa  166  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2399  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  29.43 
 
 		 411 aa  162  8.000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2283  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 456 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  hitchhiker  0.0000190717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  30.73 
 
 		 432 aa  160  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 418 aa  151  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 		 435 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  29.36 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  31.49 
 
 		 455 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  28.97 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  27.34 
 
 		 411 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  29.29 
 
 		 410 aa  139  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 410 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  28.08 
 
 		 428 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 		 415 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  26.97 
 
 		 415 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  27.58 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  26.43 
 
 		 430 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 419 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 415 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 412 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  27.88 
 
 		 414 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 412 aa  114  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  26.12 
 
 		 425 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2520  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 452 aa  111  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.420378 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1824  extracellular solute-binding protein family 1  25.36 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1813  extracellular solute-binding protein family 1  23.93 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2342  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 477 aa  93.6  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.936887  normal  0.0125511 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2112  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 		 473 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4502  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1257  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>