277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2098 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2399  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  80.29 
 
 
411 aa  667    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2337  extracellular solute-binding protein family 1  98.54 
 
 
411 aa  823    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.836128  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2098  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
411 aa  831    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.072788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1728  extracellular solute-binding protein  91 
 
 
411 aa  742    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00458236  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3454  extracellular solute-binding protein  58.11 
 
 
418 aa  484  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000480069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0882  extracellular solute-binding protein  47.3 
 
 
412 aa  341  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.297168  normal  0.673205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2083  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  43 
 
 
412 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.206037  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5887  extracellular solute-binding protein family 1  43 
 
 
412 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5435  extracellular solute-binding protein  44.09 
 
 
414 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.207139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1110  extracellular solute-binding protein  42.36 
 
 
411 aa  293  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4321  extracellular solute-binding protein  43.42 
 
 
409 aa  282  6.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1956  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  36.99 
 
 
417 aa  258  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.318288  normal  0.222736 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4568  extracellular solute-binding protein family 1  37.25 
 
 
410 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.267408  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6357  extracellular solute-binding protein family 1  37.19 
 
 
410 aa  244  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4349  extracellular solute-binding protein  34.22 
 
 
415 aa  241  2e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000381076  hitchhiker  0.000997313 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1695  extracellular solute-binding protein  35.35 
 
 
420 aa  239  5.999999999999999e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.157617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2416  extracellular solute-binding protein  35.35 
 
 
417 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.230559  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0092  extracellular solute-binding protein  40.6 
 
 
425 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0083  extracellular solute-binding protein family 1  37.01 
 
 
429 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  35.41 
 
 
420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  35.41 
 
 
420 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1150  extracellular solute-binding protein  35.98 
 
 
417 aa  226  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0392592  normal  0.752071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3935  extracellular solute-binding protein  36.26 
 
 
420 aa  224  2e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0774395  normal  0.611638 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0693  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  38.01 
 
 
421 aa  223  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0998966  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3817  extracellular solute-binding protein  37.36 
 
 
421 aa  221  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.284829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1097  extracellular solute-binding protein  35.63 
 
 
416 aa  219  5e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000486653  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3573  extracellular solute-binding protein  37.02 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0138682  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1090  extracellular solute-binding protein  34.05 
 
 
417 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3170  extracellular solute-binding protein  37.32 
 
 
414 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3689  extracellular solute-binding protein  35.95 
 
 
416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1292  glucose ABC transporter, periplasmic glucose-binding protein, putative  39.18 
 
 
428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.927491  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1113  extracellular solute-binding protein  39.18 
 
 
431 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.561117 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0523  extracellular solute-binding protein  37.24 
 
 
418 aa  211  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1053  extracellular solute-binding protein  39.67 
 
 
428 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00219882  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1482  extracellular solute-binding protein family 1  36.39 
 
 
420 aa  206  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.340124  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3786  extracellular solute-binding protein family 1  36.36 
 
 
419 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3404  extracellular solute-binding protein  32.31 
 
 
413 aa  204  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1378  extracellular solute-binding protein family 1  36.57 
 
 
420 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2284  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  31.13 
 
 
410 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.61221  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3491  extracellular solute-binding protein family 1  35.6 
 
 
419 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1015  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  38.86 
 
 
428 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4209  extracellular solute-binding protein  38.86 
 
 
428 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0860  extracellular solute-binding protein family 1  36.19 
 
 
415 aa  199  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0321479  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1013  extracellular solute-binding protein  38.59 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4370  extracellular solute-binding protein  35.51 
 
 
433 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.878399  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9200  ABC-type sugar transport system periplasmic component  34.55 
 
 
374 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3451  ABC sugar (maltose) transporter, periplasmic ligand binding protein  36.91 
 
 
415 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113592  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1028  extracellular solute-binding protein family 1  36.91 
 
 
415 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00732462  normal  0.0899654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0628  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 
415 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0489  extracellular solute-binding protein  37.47 
 
 
415 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0816838  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0929  extracellular solute-binding protein  37.47 
 
 
415 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0968  extracellular solute-binding protein  37.47 
 
 
415 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.278189  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4071  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  37.19 
 
 
415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00185695  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0840  extracellular solute-binding protein  37.19 
 
 
415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2430  extracellular solute-binding protein  37.47 
 
 
415 aa  190  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.682399  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0828  extracellular solute-binding protein  36.91 
 
 
415 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00532301  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29280  sugar ABC transport system, periplasmic substrate-binding protein  32.84 
 
 
388 aa  184  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2191  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  35.12 
 
 
415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537651  hitchhiker  0.00669154 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1553  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  35.33 
 
 
415 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0365178  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2129  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  35.03 
 
 
415 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.700761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3086  maltose ABC transporter, periplasmic maltose-binding protein  35.03 
 
 
415 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0782  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  35.03 
 
 
415 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2615  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  35.03 
 
 
415 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.813067  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  35.03 
 
 
415 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3052  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  35.03 
 
 
415 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1998  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  35.03 
 
 
415 aa  176  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6328  extracellular solute-binding protein  33.93 
 
 
415 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.634634 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6972  extracellular solute-binding protein  32.51 
 
 
402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.780279  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1515  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6314  extracellular solute-binding protein  32.03 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  34.02 
 
 
435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 
455 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  31.18 
 
 
454 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 
432 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  32.19 
 
 
434 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4278  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001061  ABC-type sugar transport system component  27.27 
 
 
414 aa  147  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  30.47 
 
 
430 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  31.4 
 
 
431 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
414 aa  140  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  30.21 
 
 
428 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2283  extracellular solute-binding protein  25.42 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  hitchhiker  0.0000190717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  29 
 
 
432 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 
416 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.591163 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
415 aa  126  7e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3657  sugar ABC transporter, substrate-binding protein  29.57 
 
 
423 aa  124  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 
414 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  29.13 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  27.76 
 
 
415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0168  extracellular solute-binding protein family 1  29.89 
 
 
412 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2380  extracellular solute-binding protein family 1  29.51 
 
 
415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0905  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 
412 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0882  extracellular solute-binding protein family 1  25.6 
 
 
419 aa  104  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.632389 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 
408 aa  95.1  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  27.04 
 
 
422 aa  90.9  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.6 
 
 
417 aa  87  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  25.23 
 
 
410 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  27.38 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 
448 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  22.06 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>